Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramef17A2ASJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramef17A2ASJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef17A2ASJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef17A2ASJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramef17A2ASJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms