Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Patl2A2ARM1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Patl2A2ARM1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Patl2A2ARM1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Patl2A2ARM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms