Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syndig1A2ANU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syndig1A2ANU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syndig1A2ANU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syndig1A2ANU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Syndig1A2ANU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1A2ANU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1A2ANU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1A2ANU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syndig1A2ANU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms