Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lcn6A2AJB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lcn6A2AJB9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn6A2AJB9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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