Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramel3A2AHA7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramel3A2AHA7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pramel3A2AHA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pramel3A2AHA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramel3A2AHA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms