Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd4A2AFR3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd4A2AFR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd4A2AFR3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms