Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80eA0A0U1RP99 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ino80eA0A0U1RP99 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ino80eA0A0U1RP99 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ino80eA0A0U1RP99 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ino80eA0A0U1RP99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms