Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms