RNA: ENST00000622018.4

HPCAL1-208, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-208ENST00000622018 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.88■■■■□ 3.81
HPCAL1-208ENST00000622018 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.15■■■■□ 3.06
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC9O60706 1549 aa32.86■■■□□ 2.85
HPCAL1-208ENST00000622018 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
HPCAL1-208ENST00000622018 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.36■■■□□ 2.77
HPCAL1-208ENST00000622018 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.13■■■□□ 2.73
HPCAL1-208ENST00000622018 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.97■■■□□ 2.71
HPCAL1-208ENST00000622018 NACADO15069 1562 aa31.96■■■□□ 2.71
HPCAL1-208ENST00000622018 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
HPCAL1-208ENST00000622018 SCRIBQ14160 1630 aa31.36■■■□□ 2.61
HPCAL1-208ENST00000622018 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.36■■■□□ 2.61
HPCAL1-208ENST00000622018 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.11■■■□□ 2.57
HPCAL1-208ENST00000622018 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.54
HPCAL1-208ENST00000622018 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.86■■■□□ 2.53
HPCAL1-208ENST00000622018 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.27■■■□□ 2.44
HPCAL1-208ENST00000622018 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
HPCAL1-208ENST00000622018 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.02■■■□□ 2.4
HPCAL1-208ENST00000622018 SMARCA4P51532 1647 aa30.01■■■□□ 2.39
HPCAL1-208ENST00000622018 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
HPCAL1-208ENST00000622018 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HPCAL1-208ENST00000622018 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
HPCAL1-208ENST00000622018 WIZO95785 1651 aa29.73■■■□□ 2.35
HPCAL1-208ENST00000622018 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.7■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.67■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.64■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 SMARCA2P51531 1590 aa29.63■■■□□ 2.33
HPCAL1-208ENST00000622018 NCAPD3P42695 1498 aa29.51■■■□□ 2.31
HPCAL1-208ENST00000622018 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.5■■■□□ 2.31
HPCAL1-208ENST00000622018 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
HPCAL1-208ENST00000622018 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
HPCAL1-208ENST00000622018 HMGXB3Q12766 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
HPCAL1-208ENST00000622018 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.12■■■□□ 2.25
HPCAL1-208ENST00000622018 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.73■■■□□ 2.19
HPCAL1-208ENST00000622018 CFTRP13569 1480 aa28.69■■■□□ 2.18
HPCAL1-208ENST00000622018 NESP48681 1621 aa28.66■■■□□ 2.18
HPCAL1-208ENST00000622018 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.6■■■□□ 2.17
HPCAL1-208ENST00000622018 PRDM2Q13029 1718 aa28.46■■■□□ 2.15
HPCAL1-208ENST00000622018 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.42■■■□□ 2.14
HPCAL1-208ENST00000622018 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.41■■■□□ 2.14
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC8Q09428 1581 aa28.32■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.29■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.28■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.27■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 ERCC6Q03468 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
HPCAL1-208ENST00000622018 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
HPCAL1-208ENST00000622018 TRIM41Q8WV44 630 aa28.13■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 SYNJ1O43426 1573 aa28.11■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 CUX1P39880 1505 aa28.11■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.08■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.03■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 TOP2BQ02880 1626 aa28.03■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 TOPBP1Q92547 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
HPCAL1-208ENST00000622018 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HPCAL1-208ENST00000622018 WDR62O43379 1518 aa27.94■■■□□ 2.06
HPCAL1-208ENST00000622018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.9■■■□□ 2.06
HPCAL1-208ENST00000622018 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HPCAL1-208ENST00000622018 SOGA1O94964 1423 aa27.77■■■□□ 2.04
HPCAL1-208ENST00000622018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.77■■■□□ 2.04
HPCAL1-208ENST00000622018 CUX2O14529 1486 aa27.72■■■□□ 2.03
HPCAL1-208ENST00000622018 IFT140Q96RY7 1462 aa27.64■■■□□ 2.02
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.63■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.6■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 WDR97A6NE52 1622 aa27.56■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 KIF27Q86VH2 1401 aa27.56■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HPCAL1-208ENST00000622018 EEA1Q15075 1411 aa27.5■■□□□ 1.99
HPCAL1-208ENST00000622018 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.993e-10■■■■■ 34.9
HPCAL1-208ENST00000622018 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.44■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.44■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.42■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 IGF1RP08069 1367 aa27.37■■□□□ 1.97
HPCAL1-208ENST00000622018 GRIN2BQ13224 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.3■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.27■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.23■■□□□ 1.95
HPCAL1-208ENST00000622018 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.21■■□□□ 1.95
HPCAL1-208ENST00000622018 PRXQ9BXM0 1461 aa27.21■■□□□ 1.95
HPCAL1-208ENST00000622018 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.19■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 CUL7Q14999 1698 aa27.19■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 KIF21BO75037 1637 aa27.15■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 ADAMTS12P58397 1594 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 GOLGA3Q08378 1498 aa27.1■■□□□ 1.93
HPCAL1-208ENST00000622018 FBLN2P98095 1184 aa27.06■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 SYNJ2O15056 1496 aa27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 GRIN2AQ12879 1464 aa26.98■■□□□ 1.91
HPCAL1-208ENST00000622018 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.89■■□□□ 1.9
HPCAL1-208ENST00000622018 CHD1O14646 1710 aa26.89■■□□□ 1.9
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP170Q5SW79 1584 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms