RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.26■□□□□ 0.83
TNS1-220ENST00000611415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-220ENST00000611415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TNS1-220ENST00000611415 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
TNS1-220ENST00000611415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.05■□□□□ 0.64
TNS1-220ENST00000611415 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.93■□□□□ 0.62
TNS1-220ENST00000611415 APLP2Q06481 763 aa18.65■□□□□ 0.58
TNS1-220ENST00000611415 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS1-220ENST00000611415 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TNS1-220ENST00000611415 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TNS1-220ENST00000611415 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TNS1-220ENST00000611415 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.33■□□□□ 0.53
TNS1-220ENST00000611415 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TNS1-220ENST00000611415 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TNS1-220ENST00000611415 TRIM41Q8WV44 630 aa18.04■□□□□ 0.48
TNS1-220ENST00000611415 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-220ENST00000611415 MYT1Q01538 1121 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-220ENST00000611415 NEFLP07196 543 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-220ENST00000611415 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS1-220ENST00000611415 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.46
TNS1-220ENST00000611415 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TNS1-220ENST00000611415 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TNS1-220ENST00000611415 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TNS1-220ENST00000611415 HRCP23327 699 aa17.58■□□□□ 0.4
TNS1-220ENST00000611415 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TNS1-220ENST00000611415 ITGAEP38570 1179 aa17.34■□□□□ 0.37
TNS1-220ENST00000611415 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-220ENST00000611415 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.29■□□□□ 0.36
TNS1-220ENST00000611415 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TNS1-220ENST00000611415 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.21■□□□□ 0.35
TNS1-220ENST00000611415 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
TNS1-220ENST00000611415 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TNS1-220ENST00000611415 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.15■□□□□ 0.34
TNS1-220ENST00000611415 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TNS1-220ENST00000611415 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TNS1-220ENST00000611415 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TNS1-220ENST00000611415 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.98■□□□□ 0.31
TNS1-220ENST00000611415 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TNS1-220ENST00000611415 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.9■□□□□ 0.3
TNS1-220ENST00000611415 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
TNS1-220ENST00000611415 BCANQ96GW7 911 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-220ENST00000611415 NEUROD1Q13562 356 aa16.83■□□□□ 0.28
TNS1-220ENST00000611415 TRIM52Q96A61 297 aa16.82■□□□□ 0.28
TNS1-220ENST00000611415 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TNS1-220ENST00000611415 ANP32CO43423 234 aa16.79■□□□□ 0.28
TNS1-220ENST00000611415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-220ENST00000611415 ABCC9O60706 1549 aa16.65■□□□□ 0.26
TNS1-220ENST00000611415 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-220ENST00000611415 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TNS1-220ENST00000611415 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TNS1-220ENST00000611415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TNS1-220ENST00000611415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
TNS1-220ENST00000611415 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TNS1-220ENST00000611415 BCL11AQ9H165 835 aa16.4■□□□□ 0.22
TNS1-220ENST00000611415 NEFMP07197 916 aa16.38■□□□□ 0.21
TNS1-220ENST00000611415 FKBP8Q14318 412 aa16.37■□□□□ 0.21
TNS1-220ENST00000611415 SLC24A1O60721 1099 aa16.36■□□□□ 0.21
TNS1-220ENST00000611415 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-220ENST00000611415 P3H3Q8IVL6 736 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-220ENST00000611415 FBLN2P98095 1184 aa16.29■□□□□ 0.2
TNS1-220ENST00000611415 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TNS1-220ENST00000611415 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
TNS1-220ENST00000611415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.26■□□□□ 0.19
TNS1-220ENST00000611415 TONSLQ96HA7 1378 aa16.25■□□□□ 0.19
TNS1-220ENST00000611415 ARID3CA6NKF2 412 aa16.25■□□□□ 0.19
TNS1-220ENST00000611415 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
TNS1-220ENST00000611415 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TNS1-220ENST00000611415 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TNS1-220ENST00000611415 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-220ENST00000611415 SCRIBQ14160 1630 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-220ENST00000611415 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-220ENST00000611415 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-220ENST00000611415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-220ENST00000611415 NBR1Q14596 966 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-220ENST00000611415 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-220ENST00000611415 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-220ENST00000611415 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-220ENST00000611415 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-220ENST00000611415 NACADO15069 1562 aa16.06■□□□□ 0.16
TNS1-220ENST00000611415 TMC1Q8TDI8 760 aa16.05■□□□□ 0.16
TNS1-220ENST00000611415 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TNS1-220ENST00000611415 MIER1Q8N108 512 aa16■□□□□ 0.15
TNS1-220ENST00000611415 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
TNS1-220ENST00000611415 MRS2Q9HD23 443 aa15.99■□□□□ 0.15
TNS1-220ENST00000611415 ARXQ96QS3 562 aa15.96■□□□□ 0.15
TNS1-220ENST00000611415 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TNS1-220ENST00000611415 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-220ENST00000611415 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.95■□□□□ 0.14
TNS1-220ENST00000611415 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TNS1-220ENST00000611415 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.9■□□□□ 0.14
TNS1-220ENST00000611415 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.132e-8■□□□□ 9.6
TNS1-220ENST00000611415 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.87■□□□□ 0.13
TNS1-220ENST00000611415 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TNS1-220ENST00000611415 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.84■□□□□ 0.13
TNS1-220ENST00000611415 BECN1Q14457 450 aa15.84■□□□□ 0.13
TNS1-220ENST00000611415 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 49.3
TNS1-220ENST00000611415 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms