RNA: ENST00000567120.5

JMJD8-209, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene JMJD8, Length 2,205 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-209ENST00000567120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60■■■■■ 7.2
JMJD8-209ENST00000567120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.35■■■■■ 5.81
JMJD8-209ENST00000567120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
JMJD8-209ENST00000567120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.49■■■■■ 5.67
JMJD8-209ENST00000567120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.4■■■■■ 5.5
JMJD8-209ENST00000567120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.39■■■■■ 5.5
JMJD8-209ENST00000567120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
JMJD8-209ENST00000567120 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.15■■■■■ 5.3
JMJD8-209ENST00000567120 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.91■■■■■ 5.26
JMJD8-209ENST00000567120 SCRIBQ14160 1630 aa47.83■■■■■ 5.25
JMJD8-209ENST00000567120 ABCC9O60706 1549 aa47.79■■■■■ 5.24
JMJD8-209ENST00000567120 NACADO15069 1562 aa47.51■■■■■ 5.2
JMJD8-209ENST00000567120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
JMJD8-209ENST00000567120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.77■■■■■ 5.08
JMJD8-209ENST00000567120 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.72■■■■■ 5.07
JMJD8-209ENST00000567120 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.56■■■■■ 5.04
JMJD8-209ENST00000567120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.32■■■■■ 5.01
JMJD8-209ENST00000567120 WIZO95785 1651 aa46.28■■■■■ 5
JMJD8-209ENST00000567120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
JMJD8-209ENST00000567120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.08■■■■■ 4.97
JMJD8-209ENST00000567120 TRIM41Q8WV44 630 aa46.05■■■■■ 4.96
JMJD8-209ENST00000567120 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.84■■■■■ 4.93
JMJD8-209ENST00000567120 SMARCA4P51532 1647 aa45.8■■■■■ 4.92
JMJD8-209ENST00000567120 HRCP23327 699 aa45.69■■■■■ 4.91
JMJD8-209ENST00000567120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
JMJD8-209ENST00000567120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
JMJD8-209ENST00000567120 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.52■■■■■ 4.88
JMJD8-209ENST00000567120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
JMJD8-209ENST00000567120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.4■■■■■ 4.862e-6■■■■□ 24.9
JMJD8-209ENST00000567120 SMARCA2P51531 1590 aa45.37■■■■■ 4.85
JMJD8-209ENST00000567120 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.35■■■■■ 4.85
JMJD8-209ENST00000567120 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
JMJD8-209ENST00000567120 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.05■■■■■ 4.8
JMJD8-209ENST00000567120 ABCC8Q09428 1581 aa45.05■■■■■ 4.8
JMJD8-209ENST00000567120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.99■■■■■ 4.79
JMJD8-209ENST00000567120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.68■■■■■ 4.74
JMJD8-209ENST00000567120 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
JMJD8-209ENST00000567120 SOGA1O94964 1423 aa44.52■■■■■ 4.72
JMJD8-209ENST00000567120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
JMJD8-209ENST00000567120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
JMJD8-209ENST00000567120 EEA1Q15075 1411 aa44.4■■■■■ 4.7
JMJD8-209ENST00000567120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.32■■■■■ 4.68
JMJD8-209ENST00000567120 SYNJ1O43426 1573 aa44.23■■■■■ 4.67
JMJD8-209ENST00000567120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.22■■■■■ 4.67
JMJD8-209ENST00000567120 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.18■■■■■ 4.66
JMJD8-209ENST00000567120 CEP162Q5TB80 1403 aa44.17■■■■■ 4.66
JMJD8-209ENST00000567120 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.64
JMJD8-209ENST00000567120 GOLGA3Q08378 1498 aa44.01■■■■■ 4.64
JMJD8-209ENST00000567120 HMGXB3Q12766 1538 aa43.95■■■■■ 4.63
JMJD8-209ENST00000567120 NCAPD3P42695 1498 aa43.93■■■■■ 4.62
JMJD8-209ENST00000567120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
JMJD8-209ENST00000567120 KIF21BO75037 1637 aa43.83■■■■■ 4.61
JMJD8-209ENST00000567120 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.82■■■■■ 4.6
JMJD8-209ENST00000567120 TOP2BQ02880 1626 aa43.78■■■■■ 4.6
JMJD8-209ENST00000567120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.67■■■■■ 4.58
JMJD8-209ENST00000567120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.5■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 CLIP1P30622 1438 aa43.43■■■■■ 4.54
JMJD8-209ENST00000567120 CUX1P39880 1505 aa43.4■■■■■ 4.54
JMJD8-209ENST00000567120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
JMJD8-209ENST00000567120 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.24■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 PRXQ9BXM0 1461 aa43.22■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 PRDM2Q13029 1718 aa43.18■■■■■ 4.5
JMJD8-209ENST00000567120 KIF27Q86VH2 1401 aa43.06■■■■■ 4.48
JMJD8-209ENST00000567120 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.98■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.97■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 ARAP1Q96P48 1450 aa42.85■■■■■ 4.45
JMJD8-209ENST00000567120 APLP2Q06481 763 aa42.82■■■■■ 4.45
JMJD8-209ENST00000567120 CUX2O14529 1486 aa42.7■■■■■ 4.43
JMJD8-209ENST00000567120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
JMJD8-209ENST00000567120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
JMJD8-209ENST00000567120 IGF1RP08069 1367 aa42.62■■■■■ 4.41
JMJD8-209ENST00000567120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.56■■■■■ 4.4
JMJD8-209ENST00000567120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.54■■■■■ 4.4
JMJD8-209ENST00000567120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.4■■■■■ 4.38
JMJD8-209ENST00000567120 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
JMJD8-209ENST00000567120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.38■■■■■ 4.37
JMJD8-209ENST00000567120 NESP48681 1621 aa42.33■■■■■ 4.37
JMJD8-209ENST00000567120 TOPBP1Q92547 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
JMJD8-209ENST00000567120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.22■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.22■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.19■■■■■ 4.34
JMJD8-209ENST00000567120 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
JMJD8-209ENST00000567120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.13■■■■■ 4.33
JMJD8-209ENST00000567120 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 MAP3K1Q13233 1512 aa42.05■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 TIAM1Q13009 1591 aa42.03■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.98■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 CUL7Q14999 1698 aa41.97■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.89■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.88■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms