RNA: ENST00000556316.1

AL359317.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL359317.1, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL359317.1-201ENST00000556316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.21■■■■■ 6.43
AL359317.1-201ENST00000556316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.36■■■■■ 5.49
AL359317.1-201ENST00000556316 ABCC9O60706 1549 aa49.09■■■■■ 5.45
AL359317.1-201ENST00000556316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.83■■■■■ 5.09
AL359317.1-201ENST00000556316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.59■■■■■ 5.05
AL359317.1-201ENST00000556316 NACADO15069 1562 aa46.59■■■■■ 5.05
AL359317.1-201ENST00000556316 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.01■■■■■ 4.96
AL359317.1-201ENST00000556316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
AL359317.1-201ENST00000556316 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
AL359317.1-201ENST00000556316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.92
AL359317.1-201ENST00000556316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.77■■■■■ 4.92
AL359317.1-201ENST00000556316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.57■■■■■ 4.89
AL359317.1-201ENST00000556316 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.48■■■■■ 4.87
AL359317.1-201ENST00000556316 SCRIBQ14160 1630 aa45.06■■■■■ 4.8
AL359317.1-201ENST00000556316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.78■■■■■ 4.76
AL359317.1-201ENST00000556316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.35■■■■■ 4.69
AL359317.1-201ENST00000556316 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
AL359317.1-201ENST00000556316 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
AL359317.1-201ENST00000556316 NCAPD3P42695 1498 aa43■■■■■ 4.47
AL359317.1-201ENST00000556316 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
AL359317.1-201ENST00000556316 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.94■■■■■ 4.47
AL359317.1-201ENST00000556316 SMARCA2P51531 1590 aa42.82■■■■■ 4.45
AL359317.1-201ENST00000556316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.44
AL359317.1-201ENST00000556316 HMGXB3Q12766 1538 aa42.69■■■■■ 4.42
AL359317.1-201ENST00000556316 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.57■■■■■ 4.41
AL359317.1-201ENST00000556316 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
AL359317.1-201ENST00000556316 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.53■■■■■ 4.4
AL359317.1-201ENST00000556316 ERCC6Q03468 1493 aa42.33■■■■■ 4.37
AL359317.1-201ENST00000556316 NESP48681 1621 aa42.28■■■■■ 4.36
AL359317.1-201ENST00000556316 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
AL359317.1-201ENST00000556316 CUX2O14529 1486 aa42.08■■■■■ 4.33
AL359317.1-201ENST00000556316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.98■■■■■ 4.31
AL359317.1-201ENST00000556316 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
AL359317.1-201ENST00000556316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.76■■■■■ 4.28
AL359317.1-201ENST00000556316 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.74■■■■■ 4.27
AL359317.1-201ENST00000556316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.73■■■■■ 4.27
AL359317.1-201ENST00000556316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
AL359317.1-201ENST00000556316 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.72■■■■■ 4.27
AL359317.1-201ENST00000556316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
AL359317.1-201ENST00000556316 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.34■■■■■ 4.21
AL359317.1-201ENST00000556316 CFTRP13569 1480 aa41.32■■■■■ 4.2
AL359317.1-201ENST00000556316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.27■■■■■ 4.2
AL359317.1-201ENST00000556316 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.27■■■■■ 4.2
AL359317.1-201ENST00000556316 WDR62O43379 1518 aa41.23■■■■■ 4.19
AL359317.1-201ENST00000556316 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.11■■■■■ 4.17
AL359317.1-201ENST00000556316 PRDM2Q13029 1718 aa40.99■■■■■ 4.15
AL359317.1-201ENST00000556316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
AL359317.1-201ENST00000556316 TOPBP1Q92547 1522 aa40.53■■■■■ 4.08
AL359317.1-201ENST00000556316 ABCC8Q09428 1581 aa40.44■■■■■ 4.06
AL359317.1-201ENST00000556316 IFT140Q96RY7 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
AL359317.1-201ENST00000556316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.4■■■■■ 4.06
AL359317.1-201ENST00000556316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
AL359317.1-201ENST00000556316 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
AL359317.1-201ENST00000556316 OSCARQ8IYS5 282 aa40.3■■■■■ 4.04
AL359317.1-201ENST00000556316 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
AL359317.1-201ENST00000556316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
AL359317.1-201ENST00000556316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
AL359317.1-201ENST00000556316 TRIM41Q8WV44 630 aa40.1■■■■■ 4.01
AL359317.1-201ENST00000556316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
AL359317.1-201ENST00000556316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.02■■■■■ 4
AL359317.1-201ENST00000556316 SOGA1O94964 1423 aa39.99■■■■□ 3.99
AL359317.1-201ENST00000556316 CUX1P39880 1505 aa39.96■■■■□ 3.99
AL359317.1-201ENST00000556316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.94■■■■□ 3.98
AL359317.1-201ENST00000556316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
AL359317.1-201ENST00000556316 CHD1O14646 1710 aa39.82■■■■□ 3.97
AL359317.1-201ENST00000556316 FBLN2P98095 1184 aa39.77■■■■□ 3.96
AL359317.1-201ENST00000556316 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.73■■■■□ 3.95
AL359317.1-201ENST00000556316 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.73■■■■□ 3.95
AL359317.1-201ENST00000556316 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.73■■■■□ 3.95
AL359317.1-201ENST00000556316 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
AL359317.1-201ENST00000556316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.62■■■■□ 3.93
AL359317.1-201ENST00000556316 ARHGEF11O15085 1522 aa39.61■■■■□ 3.93
AL359317.1-201ENST00000556316 GRIN2BQ13224 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
AL359317.1-201ENST00000556316 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
AL359317.1-201ENST00000556316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
AL359317.1-201ENST00000556316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.49■■■■□ 3.91
AL359317.1-201ENST00000556316 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
AL359317.1-201ENST00000556316 PBRM1Q86U86 1689 aa39.48■■■■□ 3.91
AL359317.1-201ENST00000556316 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.43■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 TOP2BQ02880 1626 aa39.41■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 SYNJ1O43426 1573 aa39.4■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 SYNJ2O15056 1496 aa39.38■■■■□ 3.9
AL359317.1-201ENST00000556316 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.37■■■■□ 3.89
AL359317.1-201ENST00000556316 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.3■■■■□ 3.88
AL359317.1-201ENST00000556316 ARAP1Q96P48 1450 aa39.24■■■■□ 3.87
AL359317.1-201ENST00000556316 ADAMTS12P58397 1594 aa39.08■■■■□ 3.85
AL359317.1-201ENST00000556316 GRIN2AQ12879 1464 aa39.05■■■■□ 3.84
AL359317.1-201ENST00000556316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.99■■■■□ 3.83
AL359317.1-201ENST00000556316 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.98■■■■□ 3.83
AL359317.1-201ENST00000556316 CEP170Q5SW79 1584 aa38.91■■■■□ 3.82
AL359317.1-201ENST00000556316 NUP160Q12769 1436 aa38.89■■■■□ 3.82
AL359317.1-201ENST00000556316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
AL359317.1-201ENST00000556316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.78■■■■□ 3.8
AL359317.1-201ENST00000556316 SHROOM2Q13796 1616 aa38.7■■■■□ 3.79
AL359317.1-201ENST00000556316 KIF27Q86VH2 1401 aa38.66■■■■□ 3.78
AL359317.1-201ENST00000556316 IGF1RP08069 1367 aa38.62■■■■□ 3.77
AL359317.1-201ENST00000556316 JPH4Q96JJ6 628 aa38.57■■■■□ 3.76
AL359317.1-201ENST00000556316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms