RNA: ENST00000541586.5

CCM2-218, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCM2, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-218ENST00000541586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.82■■■■■ 7.97
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CCM2-218ENST00000541586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.12■■■■■ 6.25
CCM2-218ENST00000541586 NACADO15069 1562 aa53.6■■■■■ 6.17
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CCM2-218ENST00000541586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.5■■■■■ 6.15
CCM2-218ENST00000541586 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.42■■■■■ 6.14
CCM2-218ENST00000541586 SCRIBQ14160 1630 aa52.41■■■■■ 5.98
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CCM2-218ENST00000541586 SMARCA2P51531 1590 aa49.6■■■■■ 5.53
CCM2-218ENST00000541586 WIZO95785 1651 aa49.54■■■■■ 5.52
CCM2-218ENST00000541586 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.5■■■■■ 5.51
CCM2-218ENST00000541586 NCAPD3P42695 1498 aa49.49■■■■■ 5.51
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CCM2-218ENST00000541586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.62■■■■■ 5.21
CCM2-218ENST00000541586 PRDM2Q13029 1718 aa47.55■■■■■ 5.2
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CCM2-218ENST00000541586 WDR62O43379 1518 aa46.96■■■■■ 5.11
CCM2-218ENST00000541586 TOPBP1Q92547 1522 aa46.92■■■■■ 5.1
CCM2-218ENST00000541586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
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CCM2-218ENST00000541586 CUX2O14529 1486 aa46.76■■■■■ 5.08
CCM2-218ENST00000541586 SYNJ1O43426 1573 aa46.7■■■■■ 5.07
CCM2-218ENST00000541586 TOP2BQ02880 1626 aa46.62■■■■■ 5.05
CCM2-218ENST00000541586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
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CCM2-218ENST00000541586 KIF27Q86VH2 1401 aa45.86■■■■■ 4.93
CCM2-218ENST00000541586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.82■■■■■ 4.93
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CCM2-218ENST00000541586 GRIN2BQ13224 1484 aa45.77■■■■■ 4.92
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CCM2-218ENST00000541586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.63■■■■■ 4.9
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CCM2-218ENST00000541586 NUP160Q12769 1436 aa44.9■■■■■ 4.78
CCM2-218ENST00000541586 KIF21BO75037 1637 aa44.86■■■■■ 4.77
CCM2-218ENST00000541586 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
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