RNA: ENST00000533683.6

SAMD1-202, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD1, Length 2,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-202ENST00000533683 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.38■■■■■ 7.58
SAMD1-202ENST00000533683 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.82■■■■■ 6.21
SAMD1-202ENST00000533683 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.56■■■■■ 6
SAMD1-202ENST00000533683 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.79■■■■■ 5.88
SAMD1-202ENST00000533683 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.52■■■■■ 5.84
SAMD1-202ENST00000533683 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.43■■■■■ 5.82
SAMD1-202ENST00000533683 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.46■■■■■ 5.67
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC9O60706 1549 aa50.41■■■■■ 5.66
SAMD1-202ENST00000533683 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.63
SAMD1-202ENST00000533683 NACADO15069 1562 aa49.97■■■■■ 5.59
SAMD1-202ENST00000533683 SCRIBQ14160 1630 aa49.86■■■■■ 5.57
SAMD1-202ENST00000533683 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.36■■■■■ 5.49
SAMD1-202ENST00000533683 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
SAMD1-202ENST00000533683 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.54■■■■■ 5.36
SAMD1-202ENST00000533683 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.52■■■■■ 5.36
SAMD1-202ENST00000533683 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.49■■■■■ 5.35
SAMD1-202ENST00000533683 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.31■■■■■ 5.32
SAMD1-202ENST00000533683 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.05■■■■■ 5.28
SAMD1-202ENST00000533683 WIZO95785 1651 aa47.98■■■■■ 5.27
SAMD1-202ENST00000533683 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.97■■■■■ 5.27
SAMD1-202ENST00000533683 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.82■■■■■ 5.25
SAMD1-202ENST00000533683 SMARCA4P51532 1647 aa47.76■■■■■ 5.24
SAMD1-202ENST00000533683 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
SAMD1-202ENST00000533683 TRIM41Q8WV44 630 aa47.07■■■■■ 5.13
SAMD1-202ENST00000533683 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.06■■■■■ 5.12
SAMD1-202ENST00000533683 SMARCA2P51531 1590 aa47.02■■■■■ 5.12
SAMD1-202ENST00000533683 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.01■■■■■ 5.12
SAMD1-202ENST00000533683 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
SAMD1-202ENST00000533683 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.79■■■■■ 5.08
SAMD1-202ENST00000533683 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
SAMD1-202ENST00000533683 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
SAMD1-202ENST00000533683 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
SAMD1-202ENST00000533683 ABCC8Q09428 1581 aa46.38■■■■■ 5.01
SAMD1-202ENST00000533683 NCAPD3P42695 1498 aa46.18■■■■■ 4.98
SAMD1-202ENST00000533683 HMGXB3Q12766 1538 aa46.14■■■■■ 4.98
SAMD1-202ENST00000533683 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.934e-8■■■□□ 18.1
SAMD1-202ENST00000533683 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.82■■■■■ 4.93
SAMD1-202ENST00000533683 SOGA1O94964 1423 aa45.71■■■■■ 4.91
SAMD1-202ENST00000533683 SYNJ1O43426 1573 aa45.69■■■■■ 4.9
SAMD1-202ENST00000533683 EEA1Q15075 1411 aa45.56■■■■■ 4.88
SAMD1-202ENST00000533683 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
SAMD1-202ENST00000533683 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.54■■■■■ 4.88
SAMD1-202ENST00000533683 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.51■■■■■ 4.88
SAMD1-202ENST00000533683 CFTRP13569 1480 aa45.43■■■■■ 4.86
SAMD1-202ENST00000533683 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.4■■■■■ 4.86
SAMD1-202ENST00000533683 TOP2BQ02880 1626 aa45.35■■■■■ 4.85
SAMD1-202ENST00000533683 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.26■■■■■ 4.84
SAMD1-202ENST00000533683 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
SAMD1-202ENST00000533683 PRDM2Q13029 1718 aa45.14■■■■■ 4.82
SAMD1-202ENST00000533683 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.11■■■■■ 4.81
SAMD1-202ENST00000533683 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.11■■■■■ 4.81
SAMD1-202ENST00000533683 CUX1P39880 1505 aa45.09■■■■■ 4.81
SAMD1-202ENST00000533683 GOLGA3Q08378 1498 aa45.06■■■■■ 4.8
SAMD1-202ENST00000533683 CEP162Q5TB80 1403 aa44.99■■■■■ 4.79
SAMD1-202ENST00000533683 KIF21BO75037 1637 aa44.97■■■■■ 4.79
SAMD1-202ENST00000533683 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
SAMD1-202ENST00000533683 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.96■■■■■ 4.79
SAMD1-202ENST00000533683 HRCP23327 699 aa44.86■■■■■ 4.77
SAMD1-202ENST00000533683 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.7■■■■■ 4.75
SAMD1-202ENST00000533683 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.63■■■■■ 4.74
SAMD1-202ENST00000533683 KIF27Q86VH2 1401 aa44.61■■■■■ 4.73
SAMD1-202ENST00000533683 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
SAMD1-202ENST00000533683 NESP48681 1621 aa44.56■■■■■ 4.72
SAMD1-202ENST00000533683 PRXQ9BXM0 1461 aa44.55■■■■■ 4.72
SAMD1-202ENST00000533683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.49■■■■■ 4.71
SAMD1-202ENST00000533683 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.45■■■■■ 4.71
SAMD1-202ENST00000533683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.43■■■■■ 4.7
SAMD1-202ENST00000533683 CLIP1P30622 1438 aa44.43■■■■■ 4.7
SAMD1-202ENST00000533683 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.42■■■■■ 4.7
SAMD1-202ENST00000533683 CUX2O14529 1486 aa44.35■■■■■ 4.69
SAMD1-202ENST00000533683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.32■■■■■ 4.69
SAMD1-202ENST00000533683 TOPBP1Q92547 1522 aa44.24■■■■■ 4.67
SAMD1-202ENST00000533683 IGF1RP08069 1367 aa44.19■■■■■ 4.67
SAMD1-202ENST00000533683 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.13■■■■■ 4.66
SAMD1-202ENST00000533683 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
SAMD1-202ENST00000533683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
SAMD1-202ENST00000533683 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.1■■■■■ 4.65
SAMD1-202ENST00000533683 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
SAMD1-202ENST00000533683 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.06■■■■■ 4.64
SAMD1-202ENST00000533683 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
SAMD1-202ENST00000533683 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.03■■■■■ 4.64
SAMD1-202ENST00000533683 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.97■■■■■ 4.63
SAMD1-202ENST00000533683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.93■■■■■ 4.62
SAMD1-202ENST00000533683 ARAP1Q96P48 1450 aa43.89■■■■■ 4.62
SAMD1-202ENST00000533683 WDR97A6NE52 1622 aa43.77■■■■■ 4.6
SAMD1-202ENST00000533683 APLP2Q06481 763 aa43.74■■■■■ 4.59
SAMD1-202ENST00000533683 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
SAMD1-202ENST00000533683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.72■■■■■ 4.59
SAMD1-202ENST00000533683 CUL7Q14999 1698 aa43.63■■■■■ 4.57
SAMD1-202ENST00000533683 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.58■■■■■ 4.57
SAMD1-202ENST00000533683 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.56
SAMD1-202ENST00000533683 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.5■■■■■ 4.55
SAMD1-202ENST00000533683 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
SAMD1-202ENST00000533683 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.49■■■■■ 4.55
SAMD1-202ENST00000533683 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.55
SAMD1-202ENST00000533683 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
SAMD1-202ENST00000533683 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.31■■■■■ 4.52
SAMD1-202ENST00000533683 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
SAMD1-202ENST00000533683 WDR62O43379 1518 aa43.21■■■■■ 4.51
SAMD1-202ENST00000533683 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.18■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms