RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.844e-45■■■■■ 71.2
RABGGTB-214ENST00000497648 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.426e-10■■■■■ 59
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.854e-9■■■■■ 53.2
RABGGTB-214ENST00000497648 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.955e-43■■■■■ 52.9
RABGGTB-214ENST00000497648 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.882e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-214ENST00000497648 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.442e-27■■■■■ 28.2
RABGGTB-214ENST00000497648 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.811e-53■■■■□ 22.2
RABGGTB-214ENST00000497648 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.941e-14■■■■□ 21.2
RABGGTB-214ENST00000497648 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 18.1
RABGGTB-214ENST00000497648 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.95e-37■■■□□ 17.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.152e-9■■■□□ 17
RABGGTB-214ENST00000497648 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.942e-9■■■□□ 16.4
RABGGTB-214ENST00000497648 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.21□□□□□ -1.414e-10■■■□□ 15.1
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-214ENST00000497648 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.365e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-214ENST00000497648 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.956e-15■■□□□ 13.3
RABGGTB-214ENST00000497648 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.253e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-214ENST00000497648 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.981e-323■□□□□ 11.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.983e-46■□□□□ 11.1
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.084e-19■□□□□ 10.7
RABGGTB-214ENST00000497648 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.792e-54■□□□□ 9.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.971e-27■□□□□ 8.7
RABGGTB-214ENST00000497648 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.856e-35■□□□□ 8.5
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.12e-7■□□□□ 8
Retrieved 24 of 24 RNA–protein pairs in 13.8 ms