RNA: ENST00000491749.2

EFHC1-204, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EFHC1, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-204ENST00000491749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.56■■■■■ 7.29
EFHC1-204ENST00000491749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.96■■■■■ 6.23
EFHC1-204ENST00000491749 ABCC9O60706 1549 aa52.66■■■■■ 6.02
EFHC1-204ENST00000491749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.73■■■■■ 5.71
EFHC1-204ENST00000491749 NACADO15069 1562 aa50.67■■■■■ 5.7
EFHC1-204ENST00000491749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.49■■■■■ 5.67
EFHC1-204ENST00000491749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
EFHC1-204ENST00000491749 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.36■■■■■ 5.65
EFHC1-204ENST00000491749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.15■■■■■ 5.62
EFHC1-204ENST00000491749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.65■■■■■ 5.54
EFHC1-204ENST00000491749 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.17■■■■■ 5.46
EFHC1-204ENST00000491749 SCRIBQ14160 1630 aa49.16■■■■■ 5.46
EFHC1-204ENST00000491749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.14■■■■■ 5.46
EFHC1-204ENST00000491749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.7■■■■■ 5.39
EFHC1-204ENST00000491749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.24■■■■■ 5.31
EFHC1-204ENST00000491749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
EFHC1-204ENST00000491749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.69■■■■■ 5.22
EFHC1-204ENST00000491749 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
EFHC1-204ENST00000491749 SMARCA4P51532 1647 aa47.04■■■■■ 5.12
EFHC1-204ENST00000491749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
EFHC1-204ENST00000491749 SMARCA2P51531 1590 aa46.73■■■■■ 5.07
EFHC1-204ENST00000491749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.72■■■■■ 5.07
EFHC1-204ENST00000491749 NCAPD3P42695 1498 aa46.7■■■■■ 5.07
EFHC1-204ENST00000491749 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.66■■■■■ 5.06
EFHC1-204ENST00000491749 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.58■■■■■ 5.05
EFHC1-204ENST00000491749 HMGXB3Q12766 1538 aa46.53■■■■■ 5.04
EFHC1-204ENST00000491749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
EFHC1-204ENST00000491749 WIZO95785 1651 aa46.2■■■■■ 4.99
EFHC1-204ENST00000491749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
EFHC1-204ENST00000491749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
EFHC1-204ENST00000491749 NESP48681 1621 aa45.57■■■■■ 4.89
EFHC1-204ENST00000491749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.54■■■■■ 4.88
EFHC1-204ENST00000491749 ERCC6Q03468 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
EFHC1-204ENST00000491749 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.32■■■■■ 4.84
EFHC1-204ENST00000491749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.17■■■■■ 4.82
EFHC1-204ENST00000491749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.13■■■■■ 4.82
EFHC1-204ENST00000491749 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.11■■■■■ 4.81
EFHC1-204ENST00000491749 CFTRP13569 1480 aa45.07■■■■■ 4.81
EFHC1-204ENST00000491749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
EFHC1-204ENST00000491749 CUX2O14529 1486 aa44.96■■■■■ 4.79
EFHC1-204ENST00000491749 PRDM2Q13029 1718 aa44.9■■■■■ 4.78
EFHC1-204ENST00000491749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
EFHC1-204ENST00000491749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.83■■■■■ 4.77
EFHC1-204ENST00000491749 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.8■■■■■ 4.76
EFHC1-204ENST00000491749 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.73■■■■■ 4.75
EFHC1-204ENST00000491749 WDR62O43379 1518 aa44.6■■■■■ 4.73
EFHC1-204ENST00000491749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
EFHC1-204ENST00000491749 ABCC8Q09428 1581 aa44.14■■■■■ 4.66
EFHC1-204ENST00000491749 TOPBP1Q92547 1522 aa44.13■■■■■ 4.65
EFHC1-204ENST00000491749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.11■■■■■ 4.65
EFHC1-204ENST00000491749 IFT140Q96RY7 1462 aa43.84■■■■■ 4.61
EFHC1-204ENST00000491749 CUX1P39880 1505 aa43.79■■■■■ 4.6
EFHC1-204ENST00000491749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
EFHC1-204ENST00000491749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
EFHC1-204ENST00000491749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.64■■■■■ 4.58
EFHC1-204ENST00000491749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
EFHC1-204ENST00000491749 SOGA1O94964 1423 aa43.53■■■■■ 4.56
EFHC1-204ENST00000491749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
EFHC1-204ENST00000491749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.51■■■■■ 4.56
EFHC1-204ENST00000491749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.49■■■■■ 4.553e-6■■■■■ 51.5
EFHC1-204ENST00000491749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.49■■■■■ 4.55
EFHC1-204ENST00000491749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.48■■■■■ 4.55
EFHC1-204ENST00000491749 TOP2BQ02880 1626 aa43.45■■■■■ 4.55
EFHC1-204ENST00000491749 SYNJ1O43426 1573 aa43.42■■■■■ 4.54
EFHC1-204ENST00000491749 WDR97A6NE52 1622 aa43.37■■■■■ 4.53
EFHC1-204ENST00000491749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.35■■■■■ 4.53
EFHC1-204ENST00000491749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
EFHC1-204ENST00000491749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.22■■■■■ 4.51
EFHC1-204ENST00000491749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.1■■■■■ 4.49
EFHC1-204ENST00000491749 PBRM1Q86U86 1689 aa43.07■■■■■ 4.49
EFHC1-204ENST00000491749 GRIN2BQ13224 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
EFHC1-204ENST00000491749 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.06■■■■■ 4.48
EFHC1-204ENST00000491749 OSCARQ8IYS5 282 aa43.02■■■■■ 4.48
EFHC1-204ENST00000491749 CHD1O14646 1710 aa43.02■■■■■ 4.48
EFHC1-204ENST00000491749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43■■■■■ 4.47
EFHC1-204ENST00000491749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
EFHC1-204ENST00000491749 FBLN2P98095 1184 aa42.81■■■■■ 4.44
EFHC1-204ENST00000491749 SYNJ2O15056 1496 aa42.79■■■■■ 4.44
EFHC1-204ENST00000491749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.72■■■■■ 4.43
EFHC1-204ENST00000491749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
EFHC1-204ENST00000491749 ADAMTS12P58397 1594 aa42.69■■■■■ 4.42
EFHC1-204ENST00000491749 KIF27Q86VH2 1401 aa42.59■■■■■ 4.41
EFHC1-204ENST00000491749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.55■■■■■ 4.4
EFHC1-204ENST00000491749 GRIN2AQ12879 1464 aa42.51■■■■■ 4.4
EFHC1-204ENST00000491749 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.5■■■■■ 4.39
EFHC1-204ENST00000491749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 TRIM41Q8WV44 630 aa42.41■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 CUL7Q14999 1698 aa42.39■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 ARHGEF11O15085 1522 aa42.39■■■■■ 4.38
EFHC1-204ENST00000491749 IGF1RP08069 1367 aa42.36■■■■■ 4.37
EFHC1-204ENST00000491749 CEP170Q5SW79 1584 aa42.31■■■■■ 4.36
EFHC1-204ENST00000491749 NUP160Q12769 1436 aa42.31■■■■■ 4.36
EFHC1-204ENST00000491749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.15■■■■■ 4.34
EFHC1-204ENST00000491749 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.13■■■■■ 4.33
EFHC1-204ENST00000491749 SHROOM2Q13796 1616 aa42.06■■■■■ 4.32
EFHC1-204ENST00000491749 ARAP1Q96P48 1450 aa42.04■■■■■ 4.32
EFHC1-204ENST00000491749 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
EFHC1-204ENST00000491749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.91■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms