RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.511e-323■■■■■ 36.9
RABGGTB-211ENST00000489450 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 125.1
RABGGTB-211ENST00000489450 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.821e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.4□□□□□ -2.031e-323■□□□□ 11.2
RABGGTB-211ENST00000489450 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.932e-86■■■■□ 20.4
RABGGTB-211ENST00000489450 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.991e-73■■■■□ 25.1
RABGGTB-211ENST00000489450 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.944e-50■■■■■ 40.9
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.581e-33■□□□□ 9.2
RABGGTB-211ENST00000489450 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.585e-30■□□□□ 9.5
RABGGTB-211ENST00000489450 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.782e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.782e-23■■■■■ 55
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.848e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-211ENST00000489450 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.521e-14■■■■□ 25.2
RABGGTB-211ENST00000489450 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.655e-13■□□□□ 9
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.815e-13■■■■■ 31.1
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP1.96□□□□□ -2.11e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.095e-12■■■■■ 56.2
RABGGTB-211ENST00000489450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.74e-11■■■■□ 19.8
RABGGTB-211ENST00000489450 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP2.4□□□□□ -2.033e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-211ENST00000489450 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.21□□□□□ -2.063e-10■■■□□ 18.1
RABGGTB-211ENST00000489450 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.81□□□□□ -1.969e-10■■□□□ 14.3
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.94□□□□□ -1.941e-9■■□□□ 12
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.891e-9■■■■□ 25
RABGGTB-211ENST00000489450 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.221e-9■■■□□ 15.1
RABGGTB-211ENST00000489450 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.92e-9■■■□□ 17
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.81e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-211ENST00000489450 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.998e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-211ENST00000489450 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.829e-8■□□□□ 11.2
RABGGTB-211ENST00000489450 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.21□□□□□ -1.741e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-211ENST00000489450 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-211ENST00000489450 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.854e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-211ENST00000489450 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.377e-7■□□□□ 11
RABGGTB-211ENST00000489450 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.911e-6■■■■□ 22.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.041e-6■■□□□ 13.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.86□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 31.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.91e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.723e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.794e-6■■□□□ 14
RABGGTB-211ENST00000489450 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.965e-6■■■■□ 20.5
RABGGTB-211ENST00000489450 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 11
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