RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.56■■■■■ 4.4
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.22■■■■□ 3.71
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC9O60706 1549 aa38.11■■■■□ 3.69
SKIV2L-211ENST00000485349 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.3■■■■□ 3.4
SKIV2L-211ENST00000485349 NACADO15069 1562 aa36.06■■■■□ 3.36
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.78■■■■□ 3.32
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.64■■■■□ 3.3
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.6■■■■□ 3.29
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.57■■■■□ 3.28
SKIV2L-211ENST00000485349 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.263e-6■■■■□ 21.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SKIV2L-211ENST00000485349 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.29■■■■□ 3.24
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.14■■■■□ 3.22
SKIV2L-211ENST00000485349 SCRIBQ14160 1630 aa34.84■■■■□ 3.17
SKIV2L-211ENST00000485349 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.77■■■■□ 3.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.46■■■■□ 3.11
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
SKIV2L-211ENST00000485349 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.31■■■■□ 3.08
SKIV2L-211ENST00000485349 NCAPD3P42695 1498 aa33.25■■■□□ 2.91
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCA4P51532 1647 aa33.22■■■□□ 2.91
SKIV2L-211ENST00000485349 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.18■■■□□ 2.9
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCA2P51531 1590 aa33.11■■■□□ 2.89
SKIV2L-211ENST00000485349 HMGXB3Q12766 1538 aa33.07■■■□□ 2.88
SKIV2L-211ENST00000485349 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.88■■■□□ 2.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ERCC6Q03468 1493 aa32.88■■■□□ 2.85
SKIV2L-211ENST00000485349 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
SKIV2L-211ENST00000485349 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.81■■■□□ 2.84
SKIV2L-211ENST00000485349 CUX2O14529 1486 aa32.8■■■□□ 2.84
SKIV2L-211ENST00000485349 NESP48681 1621 aa32.77■■■□□ 2.84
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.64■■■□□ 2.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.54■■■□□ 2.8
SKIV2L-211ENST00000485349 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SKIV2L-211ENST00000485349 WIZO95785 1651 aa32.46■■■□□ 2.79
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.42■■■□□ 2.78
SKIV2L-211ENST00000485349 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.29■■■□□ 2.76
SKIV2L-211ENST00000485349 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.23■■■□□ 2.75
SKIV2L-211ENST00000485349 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
SKIV2L-211ENST00000485349 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.06■■■□□ 2.72
SKIV2L-211ENST00000485349 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR62O43379 1518 aa32.01■■■□□ 2.72
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.95■■■□□ 2.7
SKIV2L-211ENST00000485349 CFTRP13569 1480 aa31.91■■■□□ 2.7
SKIV2L-211ENST00000485349 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.91■■■□□ 2.7
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDM2Q13029 1718 aa31.72■■■□□ 2.67
SKIV2L-211ENST00000485349 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.62■■■□□ 2.65
SKIV2L-211ENST00000485349 TOPBP1Q92547 1522 aa31.33■■■□□ 2.61
SKIV2L-211ENST00000485349 IFT140Q96RY7 1462 aa31.29■■■□□ 2.6
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM41Q8WV44 630 aa31.26■■■□□ 2.59
SKIV2L-211ENST00000485349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.24■■■□□ 2.59
SKIV2L-211ENST00000485349 OSCARQ8IYS5 282 aa31.22■■■□□ 2.59
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC8Q09428 1581 aa31.2■■■□□ 2.58
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
SKIV2L-211ENST00000485349 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
SKIV2L-211ENST00000485349 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
SKIV2L-211ENST00000485349 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.97■■■□□ 2.55
SKIV2L-211ENST00000485349 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.97■■■□□ 2.55
SKIV2L-211ENST00000485349 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.97■■■□□ 2.55
SKIV2L-211ENST00000485349 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
SKIV2L-211ENST00000485349 CHD1O14646 1710 aa30.93■■■□□ 2.54
SKIV2L-211ENST00000485349 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.89■■■□□ 2.54
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF11O15085 1522 aa30.84■■■□□ 2.53
SKIV2L-211ENST00000485349 CUX1P39880 1505 aa30.83■■■□□ 2.53
SKIV2L-211ENST00000485349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.83■■■□□ 2.53
SKIV2L-211ENST00000485349 SOGA1O94964 1423 aa30.81■■■□□ 2.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR97A6NE52 1622 aa30.75■■■□□ 2.51
SKIV2L-211ENST00000485349 FBLN2P98095 1184 aa30.69■■■□□ 2.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.69■■■□□ 2.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GRIN2BQ13224 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PBRM1Q86U86 1689 aa30.56■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ARAP1Q96P48 1450 aa30.56■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.53■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.52■■■□□ 2.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNJ1O43426 1573 aa30.49■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.48■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNJ2O15056 1496 aa30.48■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.47■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.47■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SKIV2L-211ENST00000485349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.38■■■□□ 2.45
SKIV2L-211ENST00000485349 TOP2BQ02880 1626 aa30.36■■■□□ 2.45
SKIV2L-211ENST00000485349 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS12P58397 1594 aa30.25■■■□□ 2.43
SKIV2L-211ENST00000485349 GRIN2AQ12879 1464 aa30.2■■■□□ 2.43
SKIV2L-211ENST00000485349 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP170Q5SW79 1584 aa30.14■■■□□ 2.42
SKIV2L-211ENST00000485349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.09■■■□□ 2.41
SKIV2L-211ENST00000485349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.08■■■□□ 2.41
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP160Q12769 1436 aa30.08■■■□□ 2.41
SKIV2L-211ENST00000485349 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.07■■■□□ 2.4
SKIV2L-211ENST00000485349 SHROOM2Q13796 1616 aa30■■■□□ 2.39
SKIV2L-211ENST00000485349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.84■■■□□ 2.37
SKIV2L-211ENST00000485349 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SKIV2L-211ENST00000485349 CUL7Q14999 1698 aa29.71■■■□□ 2.35
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF27Q86VH2 1401 aa29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms