RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.263e-45■■■■■ 92.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.092e-10■■■■■ 56.8
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-209ENST00000473406 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.554e-43■■■■■ 44.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.345e-13■■■■■ 31.1
RABGGTB-209ENST00000473406 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.1
RABGGTB-209ENST00000473406 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.481e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-209ENST00000473406 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -19e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.551e-9■■■■□ 25
RABGGTB-209ENST00000473406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.672e-11■■■■□ 24.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.18e-15■■■■□ 24
RABGGTB-209ENST00000473406 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.741e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-209ENST00000473406 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.465e-6■■■■□ 20.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 18.8
RABGGTB-209ENST00000473406 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.344e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-209ENST00000473406 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.582e-9■■■□□ 17
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.06□□□□□ -2.083e-10■■■□□ 16.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.51e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-209ENST00000473406 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.841e-9■■■□□ 15.1
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.381e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.284e-6■■□□□ 14
RABGGTB-209ENST00000473406 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.575e-7■■□□□ 13.8
RABGGTB-209ENST00000473406 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.315e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-209ENST00000473406 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.75e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.623e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.378e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.431e-9■■□□□ 12
RABGGTB-209ENST00000473406 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 11
RABGGTB-209ENST00000473406 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 11
RABGGTB-209ENST00000473406 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.63e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.161e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-209ENST00000473406 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.514e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.179e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-209ENST00000473406 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.362e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-209ENST00000473406 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -13e-30■□□□□ 9
RABGGTB-209ENST00000473406 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.195e-13■□□□□ 9
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.628e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.241e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.662e-7■□□□□ 8
Retrieved 44 of 44 RNA–protein pairs in 28.8 ms