RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.63■■■■■ 6.5
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OPN3-204ENST00000469376 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.68■■■■■ 4.9
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OPN3-204ENST00000469376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.29■■■■■ 4.84
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OPN3-204ENST00000469376 WIZO95785 1651 aa42.54■■■■■ 4.4
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OPN3-204ENST00000469376 HRCP23327 699 aa42.28■■■■■ 4.36
OPN3-204ENST00000469376 SMARCA2P51531 1590 aa42.28■■■■■ 4.36
OPN3-204ENST00000469376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.15■■■■■ 4.34
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OPN3-204ENST00000469376 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.02■■■■■ 4.32
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OPN3-204ENST00000469376 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.95■■■■■ 4.15
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OPN3-204ENST00000469376 NESP48681 1621 aa40.73■■■■■ 4.11
OPN3-204ENST00000469376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.71■■■■■ 4.11
OPN3-204ENST00000469376 PRDM2Q13029 1718 aa40.66■■■■■ 4.1
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OPN3-204ENST00000469376 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.51■■■■■ 4.08
OPN3-204ENST00000469376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.48■■■■■ 4.07
OPN3-204ENST00000469376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.07
OPN3-204ENST00000469376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.44■■■■■ 4.06
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OPN3-204ENST00000469376 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.04
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OPN3-204ENST00000469376 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.95■■■■□ 3.99
OPN3-204ENST00000469376 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.93■■■■□ 3.98
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OPN3-204ENST00000469376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
OPN3-204ENST00000469376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.84■■■■□ 3.97
OPN3-204ENST00000469376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
OPN3-204ENST00000469376 WDR62O43379 1518 aa39.72■■■■□ 3.95
OPN3-204ENST00000469376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
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OPN3-204ENST00000469376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 CUX2O14529 1486 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
OPN3-204ENST00000469376 WDR97A6NE52 1622 aa39.37■■■■□ 3.89
OPN3-204ENST00000469376 IFT140Q96RY7 1462 aa39.36■■■■□ 3.89
OPN3-204ENST00000469376 CLIP1P30622 1438 aa39.3■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.2■■■■□ 3.87
OPN3-204ENST00000469376 IGF1RP08069 1367 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.17■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.851e-12■■■■□ 20.3
OPN3-204ENST00000469376 PRXQ9BXM0 1461 aa39.06■■■■□ 3.84
OPN3-204ENST00000469376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
OPN3-204ENST00000469376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.99■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 GRIN2BQ13224 1484 aa38.96■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 PBRM1Q86U86 1689 aa38.94■■■■□ 3.82
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