RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.141e-323■■■■■ 36.9
RABGGTB-204ENST00000461653 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 125.1
RABGGTB-204ENST00000461653 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.521e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-204ENST00000461653 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.71e-323■□□□□ 11.2
RABGGTB-204ENST00000461653 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.572e-86■■■■□ 20.4
RABGGTB-204ENST00000461653 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.641e-73■■■■□ 25.1
RABGGTB-204ENST00000461653 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.37□□□□□ -1.714e-50■■■■■ 40.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.171e-33■□□□□ 9.2
RABGGTB-204ENST00000461653 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.325e-30■□□□□ 9.5
RABGGTB-204ENST00000461653 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-204ENST00000461653 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.572e-23■■■■■ 55
RABGGTB-204ENST00000461653 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.648e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.071e-14■■■■□ 25.2
RABGGTB-204ENST00000461653 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.195e-13■□□□□ 9
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.635e-13■■■■■ 31.1
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.841e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.985e-12■■■■■ 56.2
RABGGTB-204ENST00000461653 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.512e-11■■■□□ 17.2
RABGGTB-204ENST00000461653 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.851e-10■■■■■ 37.4
RABGGTB-204ENST00000461653 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.27□□□□□ -1.733e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-204ENST00000461653 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.99□□□□□ -1.933e-10■■■□□ 18.1
RABGGTB-204ENST00000461653 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.699e-10■■□□□ 14.3
RABGGTB-204ENST00000461653 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.661e-9■■□□□ 12
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.721e-9■■■■□ 25
RABGGTB-204ENST00000461653 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.471e-9■■■□□ 14.8
RABGGTB-204ENST00000461653 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.72e-9■■■□□ 17
RABGGTB-204ENST00000461653 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.561e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-204ENST00000461653 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.778e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-204ENST00000461653 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.69e-8■□□□□ 11.2
RABGGTB-204ENST00000461653 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.511e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-204ENST00000461653 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.341e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-204ENST00000461653 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.624e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.827e-7■□□□□ 11
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.37□□□□□ -1.717e-7■■■■□ 22.6
RABGGTB-204ENST00000461653 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.731e-6■■■■□ 22.3
RABGGTB-204ENST00000461653 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 31.1
RABGGTB-204ENST00000461653 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.711e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.524e-6■■□□□ 14
RABGGTB-204ENST00000461653 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.685e-6■■■■□ 20.5
RABGGTB-204ENST00000461653 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 11
Retrieved 42 of 42 RNA–protein pairs in 18.7 ms