RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.66■□□□□ 0.26
TMOD1-203ENST00000395211 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-203ENST00000395211 HRCP23327 699 aa16.27■□□□□ 0.19
TMOD1-203ENST00000395211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TMOD1-203ENST00000395211 MYT1Q01538 1121 aa15.94■□□□□ 0.14
TMOD1-203ENST00000395211 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-203ENST00000395211 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TMOD1-203ENST00000395211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TMOD1-203ENST00000395211 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.22■□□□□ 0.03
TMOD1-203ENST00000395211 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD1-203ENST00000395211 NEUROD1Q13562 356 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD1-203ENST00000395211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-203ENST00000395211 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-203ENST00000395211 BCL11AQ9H165 835 aa15.06■□□□□ 0
TMOD1-203ENST00000395211 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
TMOD1-203ENST00000395211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TMOD1-203ENST00000395211 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TMOD1-203ENST00000395211 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.99□□□□□ -0.01
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.97□□□□□ -0.01
TMOD1-203ENST00000395211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TMOD1-203ENST00000395211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.92□□□□□ -0.02
TMOD1-203ENST00000395211 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMOD1-203ENST00000395211 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TMOD1-203ENST00000395211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-203ENST00000395211 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMOD1-203ENST00000395211 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-203ENST00000395211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.58□□□□□ -0.08
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-203ENST00000395211 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-203ENST00000395211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-203ENST00000395211 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.43□□□□□ -0.1
TMOD1-203ENST00000395211 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.33□□□□□ -0.12
TMOD1-203ENST00000395211 MIER1Q8N108 512 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-203ENST00000395211 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM41Q8WV44 630 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-203ENST00000395211 BCANQ96GW7 911 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD1-203ENST00000395211 APLP2Q06481 763 aa14.14□□□□□ -0.15
TMOD1-203ENST00000395211 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
TMOD1-203ENST00000395211 ABCC9O60706 1549 aa14.13□□□□□ -0.15
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.99□□□□□ -0.17
TMOD1-203ENST00000395211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.98□□□□□ -0.17
TMOD1-203ENST00000395211 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TMOD1-203ENST00000395211 NACADO15069 1562 aa13.95□□□□□ -0.18
TMOD1-203ENST00000395211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
TMOD1-203ENST00000395211 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.94□□□□□ -0.18
TMOD1-203ENST00000395211 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TMOD1-203ENST00000395211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.89□□□□□ -0.19
TMOD1-203ENST00000395211 ITGAEP38570 1179 aa13.88□□□□□ -0.19
TMOD1-203ENST00000395211 FKBP8Q14318 412 aa13.88□□□□□ -0.19
TMOD1-203ENST00000395211 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TMOD1-203ENST00000395211 MSH5O43196 834 aa13.87□□□□□ -0.19
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
TMOD1-203ENST00000395211 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TMOD1-203ENST00000395211 NEFLP07196 543 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-203ENST00000395211 NBR1Q14596 966 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMOD1-203ENST00000395211 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.68□□□□□ -0.22
TMOD1-203ENST00000395211 KCNH8Q96L42 1107 aa13.66□□□□□ -0.22
TMOD1-203ENST00000395211 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-203ENST00000395211 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.65□□□□□ -0.22
TMOD1-203ENST00000395211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.65□□□□□ -0.23
TMOD1-203ENST00000395211 IL27Q8NEV9 243 aa13.62□□□□□ -0.23
TMOD1-203ENST00000395211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM52Q96A61 297 aa13.52□□□□□ -0.24
TMOD1-203ENST00000395211 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-203ENST00000395211 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.5□□□□□ -0.25
TMOD1-203ENST00000395211 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHG5O94827 1062 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-203ENST00000395211 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TMOD1-203ENST00000395211 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.36□□□□□ -0.27
TMOD1-203ENST00000395211 SCRIBQ14160 1630 aa13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-203ENST00000395211 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TMOD1-203ENST00000395211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TMOD1-203ENST00000395211 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.3□□□□□ -0.28
TMOD1-203ENST00000395211 SLC24A1O60721 1099 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.25□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.24□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 CEP162Q5TB80 1403 aa13.24□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 NEFMP07197 916 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 ANP32CO43423 234 aa13.18□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.17□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.16□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TMOD1-203ENST00000395211 ZMYND15Q9H091 742 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.1 ms