RNA: ENST00000383282.3

NPHP3-202, Transcript of nephrocystin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3, Length 782 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-202ENST00000383282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.9■■■■■ 8.14
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.06■■■■■ 7.04
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC9O60706 1549 aa59.02■■■■■ 7.04
NPHP3-202ENST00000383282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.24■■■■■ 6.59
NPHP3-202ENST00000383282 NACADO15069 1562 aa55.87■■■■■ 6.53
NPHP3-202ENST00000383282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.68■■■■■ 6.5
NPHP3-202ENST00000383282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.21■■■■■ 6.43
NPHP3-202ENST00000383282 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.14■■■■■ 6.42
NPHP3-202ENST00000383282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.98■■■■■ 6.39
NPHP3-202ENST00000383282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.79■■■■■ 6.36
NPHP3-202ENST00000383282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.64■■■■■ 6.34
NPHP3-202ENST00000383282 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.49■■■■■ 6.31
NPHP3-202ENST00000383282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.45■■■■■ 6.31
NPHP3-202ENST00000383282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.91■■■■■ 6.22
NPHP3-202ENST00000383282 SCRIBQ14160 1630 aa53.84■■■■■ 6.21
NPHP3-202ENST00000383282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.28■■■■■ 6.12
NPHP3-202ENST00000383282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
NPHP3-202ENST00000383282 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.18■■■■■ 6.1
NPHP3-202ENST00000383282 NCAPD3P42695 1498 aa51.58■■■■■ 5.85
NPHP3-202ENST00000383282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.43■■■■■ 5.82
NPHP3-202ENST00000383282 SMARCA4P51532 1647 aa51.36■■■■■ 5.81
NPHP3-202ENST00000383282 SMARCA2P51531 1590 aa51.32■■■■■ 5.81
NPHP3-202ENST00000383282 HMGXB3Q12766 1538 aa51.2■■■■■ 5.79
NPHP3-202ENST00000383282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.18■■■■■ 5.78
NPHP3-202ENST00000383282 ERCC6Q03468 1493 aa51.03■■■■■ 5.76
NPHP3-202ENST00000383282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
NPHP3-202ENST00000383282 CUX2O14529 1486 aa50.88■■■■■ 5.74
NPHP3-202ENST00000383282 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.87■■■■■ 5.73
NPHP3-202ENST00000383282 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.75■■■■■ 5.71
NPHP3-202ENST00000383282 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.72■■■■■ 5.71
NPHP3-202ENST00000383282 NESP48681 1621 aa50.68■■■■■ 5.7
NPHP3-202ENST00000383282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.4■■■■■ 5.66
NPHP3-202ENST00000383282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.17■■■■■ 5.62
NPHP3-202ENST00000383282 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
NPHP3-202ENST00000383282 WIZO95785 1651 aa50.11■■■■■ 5.61
NPHP3-202ENST00000383282 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.04■■■■■ 5.6
NPHP3-202ENST00000383282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.99■■■■■ 5.59
NPHP3-202ENST00000383282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
NPHP3-202ENST00000383282 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.69■■■■■ 5.54
NPHP3-202ENST00000383282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.52■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 WDR62O43379 1518 aa49.52■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 CFTRP13569 1480 aa49.46■■■■■ 5.51
NPHP3-202ENST00000383282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.46■■■■■ 5.51
NPHP3-202ENST00000383282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49■■■■■ 5.43
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.99■■■■■ 5.43
NPHP3-202ENST00000383282 PRDM2Q13029 1718 aa48.88■■■■■ 5.42
NPHP3-202ENST00000383282 OSCARQ8IYS5 282 aa48.6■■■■■ 5.37
NPHP3-202ENST00000383282 TRIM41Q8WV44 630 aa48.58■■■■■ 5.37
NPHP3-202ENST00000383282 IFT140Q96RY7 1462 aa48.55■■■■■ 5.36
NPHP3-202ENST00000383282 TOPBP1Q92547 1522 aa48.52■■■■■ 5.36
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC8Q09428 1581 aa48.48■■■■■ 5.35
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
NPHP3-202ENST00000383282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.34■■■■■ 5.33
NPHP3-202ENST00000383282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
NPHP3-202ENST00000383282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
NPHP3-202ENST00000383282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
NPHP3-202ENST00000383282 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
NPHP3-202ENST00000383282 SOGA1O94964 1423 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.84■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGEF11O15085 1522 aa47.75■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.74■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 FBLN2P98095 1184 aa47.73■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 CHD1O14646 1710 aa47.69■■■■■ 5.22
NPHP3-202ENST00000383282 CUX1P39880 1505 aa47.68■■■■■ 5.22
NPHP3-202ENST00000383282 WDR97A6NE52 1622 aa47.62■■■■■ 5.21
NPHP3-202ENST00000383282 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.52■■■■■ 5.2
NPHP3-202ENST00000383282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.44■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 GRIN2BQ13224 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 ARAP1Q96P48 1450 aa47.27■■■■■ 5.16
NPHP3-202ENST00000383282 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.26■■■■■ 5.16
NPHP3-202ENST00000383282 SYNJ2O15056 1496 aa47.25■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 SYNJ1O43426 1573 aa47.24■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.22■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.2■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 PBRM1Q86U86 1689 aa47.14■■■■■ 5.14
NPHP3-202ENST00000383282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.09■■■■■ 5.13
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.08■■■■■ 5.13
NPHP3-202ENST00000383282 TOP2BQ02880 1626 aa46.95■■■■■ 5.11
NPHP3-202ENST00000383282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.94■■■■■ 5.1
NPHP3-202ENST00000383282 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
NPHP3-202ENST00000383282 GRIN2AQ12879 1464 aa46.79■■■■■ 5.08
NPHP3-202ENST00000383282 ADAMTS12P58397 1594 aa46.74■■■■■ 5.07
NPHP3-202ENST00000383282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.69■■■■■ 5.06
NPHP3-202ENST00000383282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.64■■■■■ 5.06
NPHP3-202ENST00000383282 NUP160Q12769 1436 aa46.62■■■■■ 5.05
NPHP3-202ENST00000383282 CEP170Q5SW79 1584 aa46.56■■■■■ 5.04
NPHP3-202ENST00000383282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.43■■■■■ 5.02
NPHP3-202ENST00000383282 SHROOM2Q13796 1616 aa46.35■■■■■ 5.01
NPHP3-202ENST00000383282 JPH4Q96JJ6 628 aa46.2■■■■■ 4.99
NPHP3-202ENST00000383282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
NPHP3-202ENST00000383282 KIF27Q86VH2 1401 aa46.12■■■■■ 4.97
NPHP3-202ENST00000383282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.08■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms