RNA: ENST00000329451.7

LMNTD2-201, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMNTD2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-201ENST00000329451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.13■■■■■ 7.22
LMNTD2-201ENST00000329451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.89■■■■■ 5.9
LMNTD2-201ENST00000329451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
LMNTD2-201ENST00000329451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.83■■■■■ 5.57
LMNTD2-201ENST00000329451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.66■■■■■ 5.54
LMNTD2-201ENST00000329451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.54■■■■■ 5.52
LMNTD2-201ENST00000329451 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.72■■■■■ 5.39
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.34
LMNTD2-201ENST00000329451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
LMNTD2-201ENST00000329451 NACADO15069 1562 aa48.18■■■■■ 5.3
LMNTD2-201ENST00000329451 SCRIBQ14160 1630 aa47.98■■■■■ 5.27
LMNTD2-201ENST00000329451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.56■■■■■ 5.2
LMNTD2-201ENST00000329451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
LMNTD2-201ENST00000329451 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.8■■■■■ 5.08
LMNTD2-201ENST00000329451 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
LMNTD2-201ENST00000329451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.62■■■■■ 5.05
LMNTD2-201ENST00000329451 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.53■■■■■ 5.04
LMNTD2-201ENST00000329451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
LMNTD2-201ENST00000329451 WIZO95785 1651 aa46.18■■■■■ 4.98
LMNTD2-201ENST00000329451 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.15■■■■■ 4.98
LMNTD2-201ENST00000329451 SMARCA4P51532 1647 aa46.01■■■■■ 4.96
LMNTD2-201ENST00000329451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.94■■■■■ 4.95
LMNTD2-201ENST00000329451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
LMNTD2-201ENST00000329451 TRIM41Q8WV44 630 aa45.42■■■■■ 4.86
LMNTD2-201ENST00000329451 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.38■■■■■ 4.86
LMNTD2-201ENST00000329451 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.31■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 SMARCA2P51531 1590 aa45.3■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.1■■■■■ 4.81
LMNTD2-201ENST00000329451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.07■■■■■ 4.81
LMNTD2-201ENST00000329451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
LMNTD2-201ENST00000329451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCC8Q09428 1581 aa44.64■■■■■ 4.74
LMNTD2-201ENST00000329451 NCAPD3P42695 1498 aa44.52■■■■■ 4.72
LMNTD2-201ENST00000329451 HMGXB3Q12766 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
LMNTD2-201ENST00000329451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.25■■■■■ 4.67
LMNTD2-201ENST00000329451 EEA1Q15075 1411 aa44.06■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.04■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 SOGA1O94964 1423 aa44.04■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 SYNJ1O43426 1573 aa44.01■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.98■■■■■ 4.63
LMNTD2-201ENST00000329451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.82■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.82■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.8■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 CFTRP13569 1480 aa43.79■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 TOP2BQ02880 1626 aa43.73■■■■■ 4.59
LMNTD2-201ENST00000329451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
LMNTD2-201ENST00000329451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.64■■■■■ 4.58
LMNTD2-201ENST00000329451 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.58■■■■■ 4.57
LMNTD2-201ENST00000329451 GOLGA3Q08378 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
LMNTD2-201ENST00000329451 PRDM2Q13029 1718 aa43.49■■■■■ 4.55
LMNTD2-201ENST00000329451 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.47■■■■■ 4.55
LMNTD2-201ENST00000329451 HRCP23327 699 aa43.44■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CUX1P39880 1505 aa43.44■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.42■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CEP162Q5TB80 1403 aa43.42■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF21BO75037 1637 aa43.41■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
LMNTD2-201ENST00000329451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.08■■■■■ 4.49
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF27Q86VH2 1401 aa43.04■■■■■ 4.48
LMNTD2-201ENST00000329451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 PRXQ9BXM0 1461 aa42.98■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.96■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
LMNTD2-201ENST00000329451 CLIP1P30622 1438 aa42.88■■■■■ 4.45
LMNTD2-201ENST00000329451 NESP48681 1621 aa42.82■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.82■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.81■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 CUX2O14529 1486 aa42.74■■■■■ 4.43
LMNTD2-201ENST00000329451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.72■■■■■ 4.43
LMNTD2-201ENST00000329451 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.62■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 IGF1RP08069 1367 aa42.61■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.56■■■■■ 4.4
LMNTD2-201ENST00000329451 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.5■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.44■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 ARAP1Q96P48 1450 aa42.33■■■■■ 4.37
LMNTD2-201ENST00000329451 APLP2Q06481 763 aa42.27■■■■■ 4.36
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.22■■■■■ 4.35
LMNTD2-201ENST00000329451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.16■■■■■ 4.34
LMNTD2-201ENST00000329451 WDR97A6NE52 1622 aa42.16■■■■■ 4.34
LMNTD2-201ENST00000329451 CUL7Q14999 1698 aa42.09■■■■■ 4.33
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.99■■■■■ 4.31
LMNTD2-201ENST00000329451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.89■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
LMNTD2-201ENST00000329451 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
LMNTD2-201ENST00000329451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.73■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.69■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms