RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.15■■■■■ 7.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.75■■■■■ 5.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.44■■■■■ 5.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 SCRIBQ14160 1630 aa49.58■■■■■ 5.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.79■■■■■ 5.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.74■■■■■ 5.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCA2P51531 1590 aa46.88■■■■■ 5.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.81■■■■■ 5.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 WIZO95785 1651 aa46.76■■■■■ 5.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 CFTRP13569 1480 aa45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.26■■■■■ 4.84
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.25■■■■■ 4.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.1■■■■■ 4.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM2Q13029 1718 aa44.98■■■■■ 4.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.81■■■■■ 4.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CUX2O14529 1486 aa44.69■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR62O43379 1518 aa44.65■■■■■ 4.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TOPBP1Q92547 1522 aa44.42■■■■■ 4.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.33■■■■■ 4.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CUX1P39880 1505 aa44.26■■■■■ 4.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC8Q09428 1581 aa44.25■■■■■ 4.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.06■■■■■ 4.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.03■■■■■ 4.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNJ1O43426 1573 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.99■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT140Q96RY7 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 TOP2BQ02880 1626 aa43.88■■■■■ 4.62
CAPNS1-201ENST00000246533 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.85■■■■■ 4.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 WDR97A6NE52 1622 aa43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.55■■■■■ 4.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.38■■■■■ 4.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.36■■■■■ 4.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM41Q8WV44 630 aa43.32■■■■■ 4.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN2BQ13224 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 PBRM1Q86U86 1689 aa43.24■■■■■ 4.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.1■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD1O14646 1710 aa43.07■■■■■ 4.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF27Q86VH2 1401 aa43.05■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OSCARQ8IYS5 282 aa43.04■■■■■ 4.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.04■■■■■ 4.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 HRCP23327 699 aa42.56■■■■■ 4.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP160Q12769 1436 aa42.54■■■■■ 4.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.46■■■■■ 4.39
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.4■■■■■ 4.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PRXQ9BXM0 1461 aa42.37■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF11O15085 1522 aa42.35■■■■■ 4.37
CAPNS1-201ENST00000246533 EEA1Q15075 1411 aa42.34■■■■■ 4.37
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