Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC61Q9Y6R9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CCDC61Q9Y6R9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC61Q9Y6R9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CCDC61Q9Y6R9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CCDC61Q9Y6R9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC61Q9Y6R9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC61Q9Y6R9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC61Q9Y6R9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC61Q9Y6R9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC61Q9Y6R9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC61Q9Y6R9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC61Q9Y6R9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC61Q9Y6R9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC61Q9Y6R9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC61Q9Y6R9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC61Q9Y6R9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC61Q9Y6R9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC61Q9Y6R9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CCDC61Q9Y6R9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC61Q9Y6R9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC61Q9Y6R9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC61Q9Y6R9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC61Q9Y6R9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC61Q9Y6R9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC61Q9Y6R9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC61Q9Y6R9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC61Q9Y6R9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CCDC61Q9Y6R9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC61Q9Y6R9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC61Q9Y6R9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC61Q9Y6R9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC61Q9Y6R9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC61Q9Y6R9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CCDC61Q9Y6R9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC61Q9Y6R9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC61Q9Y6R9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC61Q9Y6R9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CCDC61Q9Y6R9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC61Q9Y6R9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC61Q9Y6R9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC61Q9Y6R9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC61Q9Y6R9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
CCDC61Q9Y6R9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC61Q9Y6R9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC61Q9Y6R9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC61Q9Y6R9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCDC61Q9Y6R9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC61Q9Y6R9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CCDC61Q9Y6R9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC61Q9Y6R9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CCDC61Q9Y6R9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC61Q9Y6R9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC61Q9Y6R9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC61Q9Y6R9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC61Q9Y6R9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CCDC61Q9Y6R9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC61Q9Y6R9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CCDC61Q9Y6R9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC61Q9Y6R9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
CCDC61Q9Y6R9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC61Q9Y6R9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC61Q9Y6R9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC61Q9Y6R9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC61Q9Y6R9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC61Q9Y6R9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC61Q9Y6R9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC61Q9Y6R9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC61Q9Y6R9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC61Q9Y6R9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC61Q9Y6R9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC61Q9Y6R9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC61Q9Y6R9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC61Q9Y6R9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC61Q9Y6R9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC61Q9Y6R9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms