Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VPS9D1Q9Y2B5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS9D1Q9Y2B5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
VPS9D1Q9Y2B5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS9D1Q9Y2B5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
VPS9D1Q9Y2B5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS9D1Q9Y2B5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VPS9D1Q9Y2B5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VPS9D1Q9Y2B5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS9D1Q9Y2B5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VPS9D1Q9Y2B5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS9D1Q9Y2B5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
VPS9D1Q9Y2B5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
VPS9D1Q9Y2B5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VPS9D1Q9Y2B5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS9D1Q9Y2B5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VPS9D1Q9Y2B5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
VPS9D1Q9Y2B5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS9D1Q9Y2B5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VPS9D1Q9Y2B5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
VPS9D1Q9Y2B5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS9D1Q9Y2B5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS9D1Q9Y2B5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS9D1Q9Y2B5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS9D1Q9Y2B5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS9D1Q9Y2B5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VPS9D1Q9Y2B5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VPS9D1Q9Y2B5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS9D1Q9Y2B5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS9D1Q9Y2B5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS9D1Q9Y2B5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS9D1Q9Y2B5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS9D1Q9Y2B5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS9D1Q9Y2B5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS9D1Q9Y2B5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS9D1Q9Y2B5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS9D1Q9Y2B5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS9D1Q9Y2B5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS9D1Q9Y2B5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS9D1Q9Y2B5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS9D1Q9Y2B5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS9D1Q9Y2B5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS9D1Q9Y2B5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS9D1Q9Y2B5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS9D1Q9Y2B5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS9D1Q9Y2B5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS9D1Q9Y2B5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS9D1Q9Y2B5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS9D1Q9Y2B5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS9D1Q9Y2B5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS9D1Q9Y2B5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS9D1Q9Y2B5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS9D1Q9Y2B5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS9D1Q9Y2B5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS9D1Q9Y2B5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS9D1Q9Y2B5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS9D1Q9Y2B5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VPS9D1Q9Y2B5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS9D1Q9Y2B5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS9D1Q9Y2B5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS9D1Q9Y2B5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS9D1Q9Y2B5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS9D1Q9Y2B5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS9D1Q9Y2B5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS9D1Q9Y2B5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS9D1Q9Y2B5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS9D1Q9Y2B5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS9D1Q9Y2B5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS9D1Q9Y2B5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS9D1Q9Y2B5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS9D1Q9Y2B5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS9D1Q9Y2B5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS9D1Q9Y2B5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS9D1Q9Y2B5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS9D1Q9Y2B5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS9D1Q9Y2B5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS9D1Q9Y2B5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS9D1Q9Y2B5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS9D1Q9Y2B5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS9D1Q9Y2B5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS9D1Q9Y2B5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS9D1Q9Y2B5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS9D1Q9Y2B5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS9D1Q9Y2B5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms