Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
TRIM35Q9UPQ4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TRIM35Q9UPQ4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRIM35Q9UPQ4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TRIM35Q9UPQ4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TRIM35Q9UPQ4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TRIM35Q9UPQ4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRIM35Q9UPQ4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRIM35Q9UPQ4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRIM35Q9UPQ4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM35Q9UPQ4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRIM35Q9UPQ4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM35Q9UPQ4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRIM35Q9UPQ4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TRIM35Q9UPQ4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TRIM35Q9UPQ4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TRIM35Q9UPQ4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TRIM35Q9UPQ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TRIM35Q9UPQ4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRIM35Q9UPQ4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM35Q9UPQ4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM35Q9UPQ4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TRIM35Q9UPQ4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM35Q9UPQ4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TRIM35Q9UPQ4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TRIM35Q9UPQ4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRIM35Q9UPQ4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRIM35Q9UPQ4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRIM35Q9UPQ4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRIM35Q9UPQ4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
TRIM35Q9UPQ4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRIM35Q9UPQ4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TRIM35Q9UPQ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRIM35Q9UPQ4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TRIM35Q9UPQ4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TRIM35Q9UPQ4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TRIM35Q9UPQ4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
TRIM35Q9UPQ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRIM35Q9UPQ4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM35Q9UPQ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRIM35Q9UPQ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM35Q9UPQ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM35Q9UPQ4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM35Q9UPQ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM35Q9UPQ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM35Q9UPQ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM35Q9UPQ4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM35Q9UPQ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM35Q9UPQ4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM35Q9UPQ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM35Q9UPQ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRIM35Q9UPQ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
TRIM35Q9UPQ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRIM35Q9UPQ4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRIM35Q9UPQ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRIM35Q9UPQ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRIM35Q9UPQ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRIM35Q9UPQ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRIM35Q9UPQ4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRIM35Q9UPQ4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRIM35Q9UPQ4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRIM35Q9UPQ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM35Q9UPQ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM35Q9UPQ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM35Q9UPQ4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM35Q9UPQ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM35Q9UPQ4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRIM35Q9UPQ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM35Q9UPQ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM35Q9UPQ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM35Q9UPQ4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM35Q9UPQ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM35Q9UPQ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM35Q9UPQ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM35Q9UPQ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM35Q9UPQ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms