Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
APOBEC3BQ9UH17 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
APOBEC3BQ9UH17 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
APOBEC3BQ9UH17 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
APOBEC3BQ9UH17 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
APOBEC3BQ9UH17 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
APOBEC3BQ9UH17 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
APOBEC3BQ9UH17 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
APOBEC3BQ9UH17 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
APOBEC3BQ9UH17 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
APOBEC3BQ9UH17 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
APOBEC3BQ9UH17 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APOBEC3BQ9UH17 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
APOBEC3BQ9UH17 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
APOBEC3BQ9UH17 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
APOBEC3BQ9UH17 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
APOBEC3BQ9UH17 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
APOBEC3BQ9UH17 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC3BQ9UH17 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APOBEC3BQ9UH17 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
APOBEC3BQ9UH17 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
APOBEC3BQ9UH17 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
APOBEC3BQ9UH17 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOBEC3BQ9UH17 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APOBEC3BQ9UH17 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
APOBEC3BQ9UH17 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
APOBEC3BQ9UH17 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
APOBEC3BQ9UH17 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
APOBEC3BQ9UH17 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APOBEC3BQ9UH17 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3BQ9UH17 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3BQ9UH17 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3BQ9UH17 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3BQ9UH17 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBEC3BQ9UH17 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOBEC3BQ9UH17 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBEC3BQ9UH17 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3BQ9UH17 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3BQ9UH17 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3BQ9UH17 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3BQ9UH17 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOBEC3BQ9UH17 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBEC3BQ9UH17 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
APOBEC3BQ9UH17 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3BQ9UH17 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3BQ9UH17 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3BQ9UH17 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3BQ9UH17 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3BQ9UH17 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBEC3BQ9UH17 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3BQ9UH17 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3BQ9UH17 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3BQ9UH17 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3BQ9UH17 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3BQ9UH17 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3BQ9UH17 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3BQ9UH17 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3BQ9UH17 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3BQ9UH17 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3BQ9UH17 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3BQ9UH17 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3BQ9UH17 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3BQ9UH17 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3BQ9UH17 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3BQ9UH17 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3BQ9UH17 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3BQ9UH17 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3BQ9UH17 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3BQ9UH17 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3BQ9UH17 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3BQ9UH17 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APOBEC3BQ9UH17 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3BQ9UH17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3BQ9UH17 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3BQ9UH17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3BQ9UH17 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3BQ9UH17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3BQ9UH17 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3BQ9UH17 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC3BQ9UH17 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3BQ9UH17 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3BQ9UH17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms