Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LHX3Q9UBR4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LHX3Q9UBR4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX3Q9UBR4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX3Q9UBR4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LHX3Q9UBR4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LHX3Q9UBR4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LHX3Q9UBR4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LHX3Q9UBR4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LHX3Q9UBR4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LHX3Q9UBR4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LHX3Q9UBR4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LHX3Q9UBR4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LHX3Q9UBR4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LHX3Q9UBR4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LHX3Q9UBR4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LHX3Q9UBR4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LHX3Q9UBR4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LHX3Q9UBR4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LHX3Q9UBR4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LHX3Q9UBR4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LHX3Q9UBR4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LHX3Q9UBR4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LHX3Q9UBR4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LHX3Q9UBR4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LHX3Q9UBR4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LHX3Q9UBR4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LHX3Q9UBR4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LHX3Q9UBR4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LHX3Q9UBR4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LHX3Q9UBR4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LHX3Q9UBR4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LHX3Q9UBR4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LHX3Q9UBR4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LHX3Q9UBR4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LHX3Q9UBR4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LHX3Q9UBR4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LHX3Q9UBR4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LHX3Q9UBR4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LHX3Q9UBR4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LHX3Q9UBR4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LHX3Q9UBR4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LHX3Q9UBR4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LHX3Q9UBR4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LHX3Q9UBR4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LHX3Q9UBR4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LHX3Q9UBR4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LHX3Q9UBR4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX3Q9UBR4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX3Q9UBR4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LHX3Q9UBR4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LHX3Q9UBR4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX3Q9UBR4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LHX3Q9UBR4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LHX3Q9UBR4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LHX3Q9UBR4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LHX3Q9UBR4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LHX3Q9UBR4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LHX3Q9UBR4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LHX3Q9UBR4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LHX3Q9UBR4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LHX3Q9UBR4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LHX3Q9UBR4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LHX3Q9UBR4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LHX3Q9UBR4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LHX3Q9UBR4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LHX3Q9UBR4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LHX3Q9UBR4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LHX3Q9UBR4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LHX3Q9UBR4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LHX3Q9UBR4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LHX3Q9UBR4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LHX3Q9UBR4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LHX3Q9UBR4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LHX3Q9UBR4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LHX3Q9UBR4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LHX3Q9UBR4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LHX3Q9UBR4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LHX3Q9UBR4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LHX3Q9UBR4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LHX3Q9UBR4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LHX3Q9UBR4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LHX3Q9UBR4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LHX3Q9UBR4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LHX3Q9UBR4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LHX3Q9UBR4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LHX3Q9UBR4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LHX3Q9UBR4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LHX3Q9UBR4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LHX3Q9UBR4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LHX3Q9UBR4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LHX3Q9UBR4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LHX3Q9UBR4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LHX3Q9UBR4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LHX3Q9UBR4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LHX3Q9UBR4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LHX3Q9UBR4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LHX3Q9UBR4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LHX3Q9UBR4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LHX3Q9UBR4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms