Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC72.62■■■■■ 9.22
CCDC180Q9P1Z9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC72.49■■■■■ 9.2
CCDC180Q9P1Z9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC71.69■■■■■ 9.07
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.98■■■■■ 8.95
CCDC180Q9P1Z9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.16■■■■■ 8.82
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC69.5■■■■■ 8.72
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC69.27■■■■■ 8.68
CCDC180Q9P1Z9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC69.23■■■■■ 8.67
CCDC180Q9P1Z9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC69.19■■■■■ 8.67
CCDC180Q9P1Z9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.9■■■■■ 8.62
CCDC180Q9P1Z9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC68.87■■■■■ 8.62
CCDC180Q9P1Z9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC68.78■■■■■ 8.6
CCDC180Q9P1Z9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC68.76■■■■■ 8.6
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC68.72■■■■■ 8.59
CCDC180Q9P1Z9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.58■■■■■ 8.57
CCDC180Q9P1Z9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.2■■■■■ 8.51
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC67.77■■■■■ 8.44
CCDC180Q9P1Z9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC67.61■■■■■ 8.41
CCDC180Q9P1Z9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC67.41■■■■■ 8.38
CCDC180Q9P1Z9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC67.37■■■■■ 8.38
CCDC180Q9P1Z9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.11■■■■■ 8.33
CCDC180Q9P1Z9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC67.11■■■■■ 8.33
CCDC180Q9P1Z9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.98■■■■■ 8.31
CCDC180Q9P1Z9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.86■■■■■ 8.29
CCDC180Q9P1Z9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC66.86■■■■■ 8.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC66.57■■■■■ 8.25
CCDC180Q9P1Z9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC66.51■■■■■ 8.24
CCDC180Q9P1Z9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC66.35■■■■■ 8.21
CCDC180Q9P1Z9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC66.32■■■■■ 8.21
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC66.3■■■■■ 8.2
CCDC180Q9P1Z9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC66.2■■■■■ 8.19
CCDC180Q9P1Z9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC66.19■■■■■ 8.19
CCDC180Q9P1Z9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.99■■■■■ 8.15
CCDC180Q9P1Z9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC65.66■■■■■ 8.1
CCDC180Q9P1Z9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC65.45■■■■■ 8.07
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC65.45■■■■■ 8.07
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC65.36■■■■■ 8.05
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC65.19■■■■■ 8.03
CCDC180Q9P1Z9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC65.12■■■■■ 8.02
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.97■■■■■ 7.99
CCDC180Q9P1Z9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC64.87■■■■■ 7.98
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC64.58■■■■■ 7.93
CCDC180Q9P1Z9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC64.23■■■■■ 7.87
CCDC180Q9P1Z9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC64.22■■■■■ 7.87
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC64.22■■■■■ 7.87
CCDC180Q9P1Z9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC64.21■■■■■ 7.87
CCDC180Q9P1Z9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC64.1■■■■■ 7.85
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC64.01■■■■■ 7.84
CCDC180Q9P1Z9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC64■■■■■ 7.84
CCDC180Q9P1Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC63.91■■■■■ 7.82
CCDC180Q9P1Z9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC63.9■■■■■ 7.82
CCDC180Q9P1Z9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC63.88■■■■■ 7.82
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC63.87■■■■■ 7.81
CCDC180Q9P1Z9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.8■■■■■ 7.8
CCDC180Q9P1Z9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.78■■■■■ 7.8
CCDC180Q9P1Z9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC63.75■■■■■ 7.8
CCDC180Q9P1Z9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC63.75■■■■■ 7.8
CCDC180Q9P1Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC63.75■■■■■ 7.8
CCDC180Q9P1Z9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC63.65■■■■■ 7.78
CCDC180Q9P1Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.56■■■■■ 7.77
CCDC180Q9P1Z9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC63.45■■■■■ 7.75
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.43■■■■■ 7.75
CCDC180Q9P1Z9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC63.37■■■■■ 7.73
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC63.32■■■■■ 7.73
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.31■■■■■ 7.73
CCDC180Q9P1Z9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC63.28■■■■■ 7.72
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC63.22■■■■■ 7.71
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.2■■■■■ 7.71
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC63.19■■■■■ 7.71
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.08■■■■■ 7.69
CCDC180Q9P1Z9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC62.97■■■■■ 7.67
CCDC180Q9P1Z9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.96■■■■■ 7.67
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC62.95■■■■■ 7.67
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.94■■■■■ 7.67
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC62.81■■■■■ 7.65
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.71■■■■■ 7.63
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC62.71■■■■■ 7.63
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC62.71■■■■■ 7.63
CCDC180Q9P1Z9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.68■■■■■ 7.62
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC62.66■■■■■ 7.62
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.65■■■■■ 7.62
CCDC180Q9P1Z9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC62.65■■■■■ 7.62
CCDC180Q9P1Z9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.64■■■■■ 7.62
CCDC180Q9P1Z9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC62.61■■■■■ 7.61
CCDC180Q9P1Z9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC62.44■■■■■ 7.59
CCDC180Q9P1Z9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC62.43■■■■■ 7.58
CCDC180Q9P1Z9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC62.42■■■■■ 7.58
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.42■■■■■ 7.58
CCDC180Q9P1Z9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.38■■■■■ 7.58
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC62.36■■■■■ 7.57
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC62.36■■■■■ 7.57
CCDC180Q9P1Z9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.34■■■■■ 7.57
CCDC180Q9P1Z9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC62.31■■■■■ 7.56
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC62.29■■■■■ 7.56
CCDC180Q9P1Z9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC62.21■■■■■ 7.55
CCDC180Q9P1Z9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.18■■■■■ 7.55
CCDC180Q9P1Z9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
CCDC180Q9P1Z9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC62.14■■■■■ 7.54
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC62.14■■■■■ 7.54
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC62.13■■■■■ 7.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms