Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN3AQ9NY46 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN3AQ9NY46 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN3AQ9NY46 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN3AQ9NY46 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCN3AQ9NY46 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN3AQ9NY46 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN3AQ9NY46 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN3AQ9NY46 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN3AQ9NY46 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN3AQ9NY46 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN3AQ9NY46 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN3AQ9NY46 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN3AQ9NY46 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN3AQ9NY46 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN3AQ9NY46 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN3AQ9NY46 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN3AQ9NY46 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN3AQ9NY46 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN3AQ9NY46 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN3AQ9NY46 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN3AQ9NY46 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN3AQ9NY46 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN3AQ9NY46 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN3AQ9NY46 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN3AQ9NY46 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN3AQ9NY46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN3AQ9NY46 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN3AQ9NY46 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN3AQ9NY46 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SCN3AQ9NY46 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN3AQ9NY46 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN3AQ9NY46 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN3AQ9NY46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN3AQ9NY46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN3AQ9NY46 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN3AQ9NY46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN3AQ9NY46 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN3AQ9NY46 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN3AQ9NY46 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN3AQ9NY46 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN3AQ9NY46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN3AQ9NY46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN3AQ9NY46 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN3AQ9NY46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN3AQ9NY46 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN3AQ9NY46 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN3AQ9NY46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN3AQ9NY46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN3AQ9NY46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN3AQ9NY46 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN3AQ9NY46 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN3AQ9NY46 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN3AQ9NY46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN3AQ9NY46 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN3AQ9NY46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN3AQ9NY46 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN3AQ9NY46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN3AQ9NY46 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN3AQ9NY46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN3AQ9NY46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN3AQ9NY46 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN3AQ9NY46 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN3AQ9NY46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN3AQ9NY46 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN3AQ9NY46 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN3AQ9NY46 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN3AQ9NY46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN3AQ9NY46 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN3AQ9NY46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN3AQ9NY46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN3AQ9NY46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN3AQ9NY46 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN3AQ9NY46 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN3AQ9NY46 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN3AQ9NY46 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN3AQ9NY46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN3AQ9NY46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN3AQ9NY46 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN3AQ9NY46 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN3AQ9NY46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN3AQ9NY46 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN3AQ9NY46 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN3AQ9NY46 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN3AQ9NY46 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN3AQ9NY46 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN3AQ9NY46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN3AQ9NY46 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN3AQ9NY46 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN3AQ9NY46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN3AQ9NY46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN3AQ9NY46 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms