Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.56■■■□□ 2.961e-323■■■■■ 196.4
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DROSHAQ9NRR4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81e-323■■■■■ 217.3
DROSHAQ9NRR4 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 126
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 321.51■■□□□ 1.038e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 313.96□□□□□ -0.188e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.114e-181■■■■■ 205.6
DROSHAQ9NRR4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.724e-166■■■■■ 200
DROSHAQ9NRR4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.286e-121■■■■■ 2049.7
DROSHAQ9NRR4 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.371e-97■■■■■ 242.2
DROSHAQ9NRR4 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC17.76■□□□□ 0.434e-89■□□□□ 8.9
DROSHAQ9NRR4 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.263e-87■■■■■ 886.2
DROSHAQ9NRR4 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.846e-86■□□□□ 9
DROSHAQ9NRR4 NEAT1_3.1-201ENST00000613347 159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.322e-85■□□□□ 9.1
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DROSHAQ9NRR4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.323e-80■■■■■ 186.5
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.461e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt17.33■□□□□ 0.361e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt16.81■□□□□ 0.281e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.393e-76■■■■■ 206.2
DROSHAQ9NRR4 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 228.67■■■□□ 2.182e-70■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.334e-62■■■■■ 439.2
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 327.33■■□□□ 1.972e-61■□□□□ 9.7
DROSHAQ9NRR4 ENO1-204ENST00000489867 732 ntTSL 1 (best)24.99■■□□□ 1.591e-60■□□□□ 9.3
DROSHAQ9NRR4 ENO1-205ENST00000492343 826 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.411e-60■□□□□ 9.3
DROSHAQ9NRR4 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 226.77■■□□□ 1.881e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 322.29■■□□□ 1.161e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 321.08■□□□□ 0.961e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 26.42□□□□□ -1.381e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.131e-60■■□□□ 12.8
DROSHAQ9NRR4 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)32.26■■■□□ 2.754e-60■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 221.91■■□□□ 1.11e-58■■■■■ 157.7
DROSHAQ9NRR4 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.764e-58■■□□□ 11.8
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 223.93■■□□□ 1.428e-57■■■■■ 114.6
DROSHAQ9NRR4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-56■■■■■ 201.8
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DROSHAQ9NRR4 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC7.09□□□□□ -1.276e-55■□□□□ 10.7
DROSHAQ9NRR4 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC6.53□□□□□ -1.366e-55■□□□□ 10.7
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DROSHAQ9NRR4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.451e-51■■□□□ 12.4
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DROSHAQ9NRR4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-49■■■■■ 68.2
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DROSHAQ9NRR4 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 429.86■■■□□ 2.378e-48■■■■□ 23.3
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DROSHAQ9NRR4 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 227.1■■□□□ 1.938e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-205ENST00000586833 558 ntTSL 521.5■■□□□ 1.038e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.948e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 312.41□□□□□ -0.428e-48■■■■□ 23.3
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DROSHAQ9NRR4 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 59.79□□□□□ -0.849e-48■□□□□ 9.9
DROSHAQ9NRR4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.044e-47■■□□□ 12.2
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DROSHAQ9NRR4 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)24.04■■□□□ 1.441e-45■■□□□ 12.3
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DROSHAQ9NRR4 MYO9B-210ENST00000597572 660 ntTSL 526.1■■□□□ 1.772e-45■■■■■ 227.3
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DROSHAQ9NRR4 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 223.89■■□□□ 1.417e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 520.03■□□□□ 0.87e-45■■■□□ 14.9
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DROSHAQ9NRR4 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 525.67■■□□□ 1.72e-44■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-210ENST00000498539 819 ntTSL 324.9■■□□□ 1.583e-44■■■■■ 30.3
DROSHAQ9NRR4 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.77□□□□□ -1.015e-44■□□□□ 9.4
DROSHAQ9NRR4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.145e-44■□□□□ 9.4
DROSHAQ9NRR4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.315e-44■□□□□ 9.4
DROSHAQ9NRR4 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.13□□□□□ -1.755e-44■□□□□ 9.4
DROSHAQ9NRR4 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.261e-43■■■■■ 169
DROSHAQ9NRR4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-43■□□□□ 11.1
DROSHAQ9NRR4 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.83□□□□□ -1.643e-43■■□□□ 14.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.491e-42■■■■■ 160.8
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.841e-42■■■■■ 160.8
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-42■■■■■ 160.8
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 328■■■□□ 2.071e-42■■■■■ 166.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 230.89■■■□□ 2.541e-42■■■■■ 170.5
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.511e-42■■■■■ 174.2
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 227.33■■□□□ 1.975e-42■■□□□ 14.2
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-208ENST00000490359 540 ntTSL 225.65■■□□□ 1.77e-42■■■■■ 28.6
DROSHAQ9NRR4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.912e-41■□□□□ 10.6
DROSHAQ9NRR4 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 26.81□□□□□ -1.322e-41■□□□□ 10.6
DROSHAQ9NRR4 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.622e-41■□□□□ 10.6
DROSHAQ9NRR4 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 222.78■■□□□ 1.243e-40■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.41■■□□□ 1.981e-39■■■■■ 71.2
DROSHAQ9NRR4 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt44.52■■■■■ 4.727e-39■□□□□ 9.5
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