Protein: Q9NR30

DDX21, Nucleolar RNA helicase 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX21Q9NR30 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 912.3
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DDX21Q9NR30 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 222.79■■□□□ 1.241e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.811e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-26■■■■■ 198.7
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DDX21Q9NR30 ARMC3-213ENST00000496741 572 ntTSL 44.8□□□□□ -1.644e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.043e-13■■■■■ 99.3
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DDX21Q9NR30 KCTD8-202ENST00000515268 464 ntTSL 33.11□□□□□ -1.912e-12■■■■■ 93.1
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DDX21Q9NR30 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.97□□□□□ -2.091e-11■■■■■ 86.9
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DDX21Q9NR30 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.119e-11■■■■■ 80.7
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 520.86■□□□□ 0.931e-11■■■■■ 76.7
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 75.8
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.066e-10■■■■■ 74.5
DDX21Q9NR30 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-10■■■■■ 74.5
DDX21Q9NR30 FBP1-202ENST00000414122 629 ntTSL 516.75■□□□□ 0.276e-10■■■■■ 74.5
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 525.97■■□□□ 1.751e-11■■■■■ 70.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 518.41■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 70.8
DDX21Q9NR30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.834e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.634e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-204ENST00000458509 407 ntTSL 1 (best)28.89■■■□□ 2.224e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.243e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-201ENST00000417516 390 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.16□□□□□ -1.583e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-8■■■■■ 65.2
DDX21Q9NR30 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-8■■■■■ 65.1
DDX21Q9NR30 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 62.1
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