Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
RTN4Q9NQC3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RTN4Q9NQC3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RTN4Q9NQC3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RTN4Q9NQC3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RTN4Q9NQC3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RTN4Q9NQC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RTN4Q9NQC3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RTN4Q9NQC3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RTN4Q9NQC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RTN4Q9NQC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RTN4Q9NQC3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RTN4Q9NQC3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RTN4Q9NQC3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RTN4Q9NQC3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RTN4Q9NQC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RTN4Q9NQC3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RTN4Q9NQC3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RTN4Q9NQC3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTN4Q9NQC3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RTN4Q9NQC3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RTN4Q9NQC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RTN4Q9NQC3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RTN4Q9NQC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTN4Q9NQC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RTN4Q9NQC3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTN4Q9NQC3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RTN4Q9NQC3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RTN4Q9NQC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTN4Q9NQC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RTN4Q9NQC3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTN4Q9NQC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTN4Q9NQC3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RTN4Q9NQC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RTN4Q9NQC3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RTN4Q9NQC3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTN4Q9NQC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTN4Q9NQC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RTN4Q9NQC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RTN4Q9NQC3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RTN4Q9NQC3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RTN4Q9NQC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RTN4Q9NQC3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RTN4Q9NQC3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RTN4Q9NQC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTN4Q9NQC3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTN4Q9NQC3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTN4Q9NQC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTN4Q9NQC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTN4Q9NQC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTN4Q9NQC3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTN4Q9NQC3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTN4Q9NQC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTN4Q9NQC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTN4Q9NQC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTN4Q9NQC3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RTN4Q9NQC3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RTN4Q9NQC3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RTN4Q9NQC3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RTN4Q9NQC3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RTN4Q9NQC3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RTN4Q9NQC3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RTN4Q9NQC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RTN4Q9NQC3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTN4Q9NQC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTN4Q9NQC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTN4Q9NQC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTN4Q9NQC3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RTN4Q9NQC3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RTN4Q9NQC3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RTN4Q9NQC3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RTN4Q9NQC3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTN4Q9NQC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RTN4Q9NQC3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RTN4Q9NQC3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RTN4Q9NQC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RTN4Q9NQC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RTN4Q9NQC3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RTN4Q9NQC3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTN4Q9NQC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RTN4Q9NQC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RTN4Q9NQC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RTN4Q9NQC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTN4Q9NQC3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTN4Q9NQC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RTN4Q9NQC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RTN4Q9NQC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RTN4Q9NQC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTN4Q9NQC3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTN4Q9NQC3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTN4Q9NQC3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTN4Q9NQC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RTN4Q9NQC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms