Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCIF1Q9H4Z3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCIF1Q9H4Z3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PCIF1Q9H4Z3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCIF1Q9H4Z3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCIF1Q9H4Z3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCIF1Q9H4Z3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCIF1Q9H4Z3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCIF1Q9H4Z3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCIF1Q9H4Z3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCIF1Q9H4Z3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCIF1Q9H4Z3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCIF1Q9H4Z3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCIF1Q9H4Z3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCIF1Q9H4Z3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCIF1Q9H4Z3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCIF1Q9H4Z3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCIF1Q9H4Z3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCIF1Q9H4Z3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCIF1Q9H4Z3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCIF1Q9H4Z3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCIF1Q9H4Z3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCIF1Q9H4Z3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCIF1Q9H4Z3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCIF1Q9H4Z3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCIF1Q9H4Z3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCIF1Q9H4Z3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCIF1Q9H4Z3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCIF1Q9H4Z3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PCIF1Q9H4Z3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCIF1Q9H4Z3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PCIF1Q9H4Z3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCIF1Q9H4Z3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCIF1Q9H4Z3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCIF1Q9H4Z3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCIF1Q9H4Z3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCIF1Q9H4Z3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCIF1Q9H4Z3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCIF1Q9H4Z3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCIF1Q9H4Z3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PCIF1Q9H4Z3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCIF1Q9H4Z3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCIF1Q9H4Z3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PCIF1Q9H4Z3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PCIF1Q9H4Z3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCIF1Q9H4Z3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCIF1Q9H4Z3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCIF1Q9H4Z3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCIF1Q9H4Z3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCIF1Q9H4Z3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCIF1Q9H4Z3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCIF1Q9H4Z3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCIF1Q9H4Z3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCIF1Q9H4Z3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCIF1Q9H4Z3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PCIF1Q9H4Z3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PCIF1Q9H4Z3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PCIF1Q9H4Z3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCIF1Q9H4Z3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PCIF1Q9H4Z3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PCIF1Q9H4Z3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PCIF1Q9H4Z3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCIF1Q9H4Z3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCIF1Q9H4Z3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCIF1Q9H4Z3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCIF1Q9H4Z3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCIF1Q9H4Z3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PCIF1Q9H4Z3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PCIF1Q9H4Z3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCIF1Q9H4Z3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PCIF1Q9H4Z3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCIF1Q9H4Z3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCIF1Q9H4Z3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCIF1Q9H4Z3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCIF1Q9H4Z3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCIF1Q9H4Z3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCIF1Q9H4Z3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCIF1Q9H4Z3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCIF1Q9H4Z3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCIF1Q9H4Z3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCIF1Q9H4Z3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PCIF1Q9H4Z3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCIF1Q9H4Z3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCIF1Q9H4Z3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCIF1Q9H4Z3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PCIF1Q9H4Z3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCIF1Q9H4Z3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PCIF1Q9H4Z3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PCIF1Q9H4Z3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCIF1Q9H4Z3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PCIF1Q9H4Z3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PCIF1Q9H4Z3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PCIF1Q9H4Z3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCIF1Q9H4Z3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCIF1Q9H4Z3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCIF1Q9H4Z3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PCIF1Q9H4Z3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCIF1Q9H4Z3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCIF1Q9H4Z3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCIF1Q9H4Z3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms