Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnft1Q9DCN7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rnft1Q9DCN7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rnft1Q9DCN7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rnft1Q9DCN7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rnft1Q9DCN7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rnft1Q9DCN7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rnft1Q9DCN7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rnft1Q9DCN7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rnft1Q9DCN7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rnft1Q9DCN7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rnft1Q9DCN7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rnft1Q9DCN7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rnft1Q9DCN7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rnft1Q9DCN7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rnft1Q9DCN7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Rnft1Q9DCN7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Rnft1Q9DCN7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnft1Q9DCN7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnft1Q9DCN7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnft1Q9DCN7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnft1Q9DCN7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnft1Q9DCN7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnft1Q9DCN7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnft1Q9DCN7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnft1Q9DCN7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnft1Q9DCN7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnft1Q9DCN7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rnft1Q9DCN7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnft1Q9DCN7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rnft1Q9DCN7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnft1Q9DCN7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnft1Q9DCN7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnft1Q9DCN7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnft1Q9DCN7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rnft1Q9DCN7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnft1Q9DCN7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnft1Q9DCN7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnft1Q9DCN7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnft1Q9DCN7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnft1Q9DCN7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnft1Q9DCN7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnft1Q9DCN7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnft1Q9DCN7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnft1Q9DCN7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnft1Q9DCN7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnft1Q9DCN7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnft1Q9DCN7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnft1Q9DCN7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnft1Q9DCN7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnft1Q9DCN7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnft1Q9DCN7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnft1Q9DCN7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnft1Q9DCN7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnft1Q9DCN7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnft1Q9DCN7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnft1Q9DCN7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnft1Q9DCN7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rnft1Q9DCN7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnft1Q9DCN7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnft1Q9DCN7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnft1Q9DCN7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnft1Q9DCN7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnft1Q9DCN7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnft1Q9DCN7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnft1Q9DCN7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnft1Q9DCN7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnft1Q9DCN7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnft1Q9DCN7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnft1Q9DCN7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnft1Q9DCN7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnft1Q9DCN7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnft1Q9DCN7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnft1Q9DCN7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnft1Q9DCN7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnft1Q9DCN7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnft1Q9DCN7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnft1Q9DCN7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnft1Q9DCN7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnft1Q9DCN7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnft1Q9DCN7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnft1Q9DCN7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnft1Q9DCN7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnft1Q9DCN7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnft1Q9DCN7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnft1Q9DCN7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnft1Q9DCN7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnft1Q9DCN7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnft1Q9DCN7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnft1Q9DCN7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnft1Q9DCN7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rnft1Q9DCN7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnft1Q9DCN7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnft1Q9DCN7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms