Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim42Q9D2H5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim42Q9D2H5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim42Q9D2H5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trim42Q9D2H5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim42Q9D2H5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Trim42Q9D2H5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Trim42Q9D2H5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trim42Q9D2H5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim42Q9D2H5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trim42Q9D2H5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trim42Q9D2H5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trim42Q9D2H5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trim42Q9D2H5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Trim42Q9D2H5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trim42Q9D2H5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trim42Q9D2H5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Trim42Q9D2H5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim42Q9D2H5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim42Q9D2H5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim42Q9D2H5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim42Q9D2H5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim42Q9D2H5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim42Q9D2H5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim42Q9D2H5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim42Q9D2H5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim42Q9D2H5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim42Q9D2H5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim42Q9D2H5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim42Q9D2H5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim42Q9D2H5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim42Q9D2H5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim42Q9D2H5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim42Q9D2H5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim42Q9D2H5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim42Q9D2H5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim42Q9D2H5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trim42Q9D2H5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim42Q9D2H5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim42Q9D2H5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim42Q9D2H5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim42Q9D2H5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim42Q9D2H5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim42Q9D2H5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim42Q9D2H5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim42Q9D2H5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim42Q9D2H5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim42Q9D2H5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim42Q9D2H5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim42Q9D2H5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim42Q9D2H5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim42Q9D2H5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim42Q9D2H5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim42Q9D2H5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim42Q9D2H5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim42Q9D2H5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim42Q9D2H5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim42Q9D2H5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim42Q9D2H5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim42Q9D2H5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim42Q9D2H5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim42Q9D2H5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim42Q9D2H5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim42Q9D2H5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim42Q9D2H5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim42Q9D2H5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim42Q9D2H5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim42Q9D2H5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim42Q9D2H5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim42Q9D2H5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim42Q9D2H5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim42Q9D2H5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim42Q9D2H5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim42Q9D2H5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim42Q9D2H5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim42Q9D2H5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim42Q9D2H5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim42Q9D2H5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim42Q9D2H5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim42Q9D2H5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim42Q9D2H5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim42Q9D2H5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim42Q9D2H5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim42Q9D2H5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim42Q9D2H5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim42Q9D2H5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim42Q9D2H5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim42Q9D2H5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim42Q9D2H5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim42Q9D2H5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim42Q9D2H5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim42Q9D2H5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim42Q9D2H5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim42Q9D2H5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim42Q9D2H5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms