Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chchd1Q9CQA6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chchd1Q9CQA6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chchd1Q9CQA6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chchd1Q9CQA6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chchd1Q9CQA6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chchd1Q9CQA6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chchd1Q9CQA6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chchd1Q9CQA6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chchd1Q9CQA6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chchd1Q9CQA6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chchd1Q9CQA6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chchd1Q9CQA6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chchd1Q9CQA6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chchd1Q9CQA6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chchd1Q9CQA6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chchd1Q9CQA6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd1Q9CQA6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd1Q9CQA6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd1Q9CQA6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chchd1Q9CQA6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd1Q9CQA6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd1Q9CQA6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chchd1Q9CQA6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chchd1Q9CQA6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd1Q9CQA6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chchd1Q9CQA6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chchd1Q9CQA6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chchd1Q9CQA6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chchd1Q9CQA6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chchd1Q9CQA6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chchd1Q9CQA6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chchd1Q9CQA6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chchd1Q9CQA6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chchd1Q9CQA6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chchd1Q9CQA6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chchd1Q9CQA6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chchd1Q9CQA6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chchd1Q9CQA6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chchd1Q9CQA6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chchd1Q9CQA6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chchd1Q9CQA6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chchd1Q9CQA6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chchd1Q9CQA6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chchd1Q9CQA6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chchd1Q9CQA6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chchd1Q9CQA6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chchd1Q9CQA6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chchd1Q9CQA6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chchd1Q9CQA6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chchd1Q9CQA6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd1Q9CQA6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd1Q9CQA6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd1Q9CQA6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd1Q9CQA6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd1Q9CQA6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd1Q9CQA6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd1Q9CQA6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chchd1Q9CQA6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd1Q9CQA6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd1Q9CQA6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd1Q9CQA6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd1Q9CQA6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chchd1Q9CQA6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chchd1Q9CQA6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chchd1Q9CQA6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chchd1Q9CQA6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chchd1Q9CQA6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chchd1Q9CQA6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chchd1Q9CQA6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chchd1Q9CQA6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chchd1Q9CQA6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chchd1Q9CQA6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chchd1Q9CQA6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chchd1Q9CQA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chchd1Q9CQA6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chchd1Q9CQA6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chchd1Q9CQA6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Chchd1Q9CQA6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chchd1Q9CQA6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chchd1Q9CQA6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chchd1Q9CQA6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chchd1Q9CQA6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chchd1Q9CQA6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chchd1Q9CQA6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chchd1Q9CQA6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chchd1Q9CQA6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms