Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
COL25A1Q9BXS0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
COL25A1Q9BXS0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL25A1Q9BXS0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
COL25A1Q9BXS0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
COL25A1Q9BXS0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
COL25A1Q9BXS0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL25A1Q9BXS0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL25A1Q9BXS0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL25A1Q9BXS0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
COL25A1Q9BXS0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL25A1Q9BXS0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL25A1Q9BXS0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL25A1Q9BXS0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL25A1Q9BXS0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL25A1Q9BXS0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL25A1Q9BXS0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
COL25A1Q9BXS0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL25A1Q9BXS0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL25A1Q9BXS0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL25A1Q9BXS0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL25A1Q9BXS0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL25A1Q9BXS0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL25A1Q9BXS0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL25A1Q9BXS0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL25A1Q9BXS0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL25A1Q9BXS0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
COL25A1Q9BXS0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
COL25A1Q9BXS0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL25A1Q9BXS0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL25A1Q9BXS0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
COL25A1Q9BXS0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
COL25A1Q9BXS0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL25A1Q9BXS0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL25A1Q9BXS0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
COL25A1Q9BXS0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL25A1Q9BXS0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL25A1Q9BXS0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
COL25A1Q9BXS0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL25A1Q9BXS0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL25A1Q9BXS0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL25A1Q9BXS0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
COL25A1Q9BXS0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL25A1Q9BXS0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL25A1Q9BXS0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL25A1Q9BXS0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL25A1Q9BXS0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL25A1Q9BXS0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL25A1Q9BXS0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL25A1Q9BXS0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL25A1Q9BXS0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL25A1Q9BXS0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL25A1Q9BXS0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL25A1Q9BXS0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL25A1Q9BXS0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL25A1Q9BXS0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL25A1Q9BXS0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL25A1Q9BXS0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
COL25A1Q9BXS0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL25A1Q9BXS0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL25A1Q9BXS0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL25A1Q9BXS0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
COL25A1Q9BXS0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL25A1Q9BXS0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL25A1Q9BXS0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL25A1Q9BXS0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
COL25A1Q9BXS0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL25A1Q9BXS0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL25A1Q9BXS0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL25A1Q9BXS0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL25A1Q9BXS0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL25A1Q9BXS0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL25A1Q9BXS0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL25A1Q9BXS0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL25A1Q9BXS0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL25A1Q9BXS0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
COL25A1Q9BXS0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
COL25A1Q9BXS0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COL25A1Q9BXS0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
COL25A1Q9BXS0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COL25A1Q9BXS0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
COL25A1Q9BXS0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
COL25A1Q9BXS0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
COL25A1Q9BXS0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
COL25A1Q9BXS0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
COL25A1Q9BXS0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
COL25A1Q9BXS0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
COL25A1Q9BXS0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COL25A1Q9BXS0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COL25A1Q9BXS0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL25A1Q9BXS0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL25A1Q9BXS0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms