Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYNGAP1Q96PV0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNGAP1Q96PV0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYNGAP1Q96PV0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNGAP1Q96PV0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNGAP1Q96PV0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNGAP1Q96PV0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNGAP1Q96PV0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNGAP1Q96PV0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNGAP1Q96PV0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNGAP1Q96PV0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNGAP1Q96PV0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNGAP1Q96PV0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNGAP1Q96PV0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNGAP1Q96PV0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNGAP1Q96PV0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNGAP1Q96PV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNGAP1Q96PV0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNGAP1Q96PV0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SYNGAP1Q96PV0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNGAP1Q96PV0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNGAP1Q96PV0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNGAP1Q96PV0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYNGAP1Q96PV0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYNGAP1Q96PV0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYNGAP1Q96PV0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNGAP1Q96PV0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNGAP1Q96PV0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNGAP1Q96PV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYNGAP1Q96PV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNGAP1Q96PV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNGAP1Q96PV0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNGAP1Q96PV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNGAP1Q96PV0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNGAP1Q96PV0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYNGAP1Q96PV0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYNGAP1Q96PV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SYNGAP1Q96PV0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYNGAP1Q96PV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYNGAP1Q96PV0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNGAP1Q96PV0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNGAP1Q96PV0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNGAP1Q96PV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNGAP1Q96PV0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNGAP1Q96PV0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNGAP1Q96PV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNGAP1Q96PV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNGAP1Q96PV0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNGAP1Q96PV0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNGAP1Q96PV0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNGAP1Q96PV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNGAP1Q96PV0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNGAP1Q96PV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNGAP1Q96PV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNGAP1Q96PV0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNGAP1Q96PV0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNGAP1Q96PV0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNGAP1Q96PV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNGAP1Q96PV0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNGAP1Q96PV0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNGAP1Q96PV0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNGAP1Q96PV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNGAP1Q96PV0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNGAP1Q96PV0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNGAP1Q96PV0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNGAP1Q96PV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNGAP1Q96PV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNGAP1Q96PV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNGAP1Q96PV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNGAP1Q96PV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNGAP1Q96PV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNGAP1Q96PV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNGAP1Q96PV0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNGAP1Q96PV0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNGAP1Q96PV0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNGAP1Q96PV0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNGAP1Q96PV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNGAP1Q96PV0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNGAP1Q96PV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNGAP1Q96PV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNGAP1Q96PV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms