Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP9XQ93008 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP9XQ93008 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP9XQ93008 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP9XQ93008 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP9XQ93008 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP9XQ93008 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP9XQ93008 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP9XQ93008 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP9XQ93008 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP9XQ93008 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP9XQ93008 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP9XQ93008 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP9XQ93008 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP9XQ93008 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP9XQ93008 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP9XQ93008 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP9XQ93008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP9XQ93008 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP9XQ93008 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP9XQ93008 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP9XQ93008 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP9XQ93008 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP9XQ93008 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP9XQ93008 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP9XQ93008 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP9XQ93008 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP9XQ93008 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP9XQ93008 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP9XQ93008 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP9XQ93008 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP9XQ93008 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP9XQ93008 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP9XQ93008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP9XQ93008 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP9XQ93008 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP9XQ93008 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP9XQ93008 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms