Protein: Q92900

UPF1, Regulator of nonsense transcripts 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UPF1Q92900 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.663e-18■■■■■ 86.9
UPF1Q92900 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.393e-18■■■■■ 86.9
UPF1Q92900 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-20■■■■■ 86.8
UPF1Q92900 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.692e-267■■■■■ 85.9
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UPF1Q92900 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-10■■■■■ 84.5
UPF1Q92900 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.368e-10■■■■■ 84.5
UPF1Q92900 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-20■■■■■ 84.4
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UPF1Q92900 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 83.5
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