Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC59.51■■■■■ 7.12
TOPBP1Q92547 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC59.47■■■■■ 7.11
TOPBP1Q92547 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC58.76■■■■■ 7
TOPBP1Q92547 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.17■■■■■ 6.9
TOPBP1Q92547 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.5■■■■■ 6.79
TOPBP1Q92547 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.95■■■■■ 6.71
TOPBP1Q92547 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.82■■■■■ 6.69
TOPBP1Q92547 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.74■■■■■ 6.67
TOPBP1Q92547 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC56.69■■■■■ 6.67
TOPBP1Q92547 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC56.5■■■■■ 6.64
TOPBP1Q92547 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.41■■■■■ 6.62
TOPBP1Q92547 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC56.39■■■■■ 6.62
TOPBP1Q92547 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.35■■■■■ 6.61
TOPBP1Q92547 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC56.31■■■■■ 6.6
TOPBP1Q92547 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.23■■■■■ 6.59
TOPBP1Q92547 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
TOPBP1Q92547 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
TOPBP1Q92547 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.42■■■■■ 6.46
TOPBP1Q92547 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.29■■■■■ 6.44
TOPBP1Q92547 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.14■■■■■ 6.42
TOPBP1Q92547 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
TOPBP1Q92547 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
TOPBP1Q92547 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
TOPBP1Q92547 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC54.88■■■■■ 6.38
TOPBP1Q92547 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
TOPBP1Q92547 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.64■■■■■ 6.34
TOPBP1Q92547 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC54.57■■■■■ 6.33
TOPBP1Q92547 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.55■■■■■ 6.32
TOPBP1Q92547 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC54.38■■■■■ 6.3
TOPBP1Q92547 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC54.31■■■■■ 6.28
TOPBP1Q92547 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC54.24■■■■■ 6.27
TOPBP1Q92547 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.06■■■■■ 6.24
TOPBP1Q92547 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.23
TOPBP1Q92547 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
TOPBP1Q92547 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC53.74■■■■■ 6.19
TOPBP1Q92547 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC53.69■■■■■ 6.19
TOPBP1Q92547 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.63■■■■■ 6.18
TOPBP1Q92547 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC53.46■■■■■ 6.15
TOPBP1Q92547 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.36■■■■■ 6.13
TOPBP1Q92547 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
TOPBP1Q92547 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC53.11■■■■■ 6.09
TOPBP1Q92547 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.93■■■■■ 6.06
TOPBP1Q92547 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC52.79■■■■■ 6.04
TOPBP1Q92547 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.7■■■■■ 6.03
TOPBP1Q92547 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.03
TOPBP1Q92547 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
TOPBP1Q92547 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
TOPBP1Q92547 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC52.46■■■■■ 5.99
TOPBP1Q92547 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
TOPBP1Q92547 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
TOPBP1Q92547 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
TOPBP1Q92547 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
TOPBP1Q92547 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC52.3■■■■■ 5.96
TOPBP1Q92547 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
TOPBP1Q92547 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.09■■■■■ 5.93
TOPBP1Q92547 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
TOPBP1Q92547 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
TOPBP1Q92547 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
TOPBP1Q92547 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.92■■■■■ 5.9
TOPBP1Q92547 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
TOPBP1Q92547 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
TOPBP1Q92547 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
TOPBP1Q92547 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
TOPBP1Q92547 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC51.72■■■■■ 5.87
TOPBP1Q92547 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
TOPBP1Q92547 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
TOPBP1Q92547 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
TOPBP1Q92547 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
TOPBP1Q92547 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
TOPBP1Q92547 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
TOPBP1Q92547 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC51.53■■■■■ 5.84
TOPBP1Q92547 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
TOPBP1Q92547 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
TOPBP1Q92547 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.82
TOPBP1Q92547 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
TOPBP1Q92547 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
TOPBP1Q92547 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
TOPBP1Q92547 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
TOPBP1Q92547 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
TOPBP1Q92547 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC51.2■■■■■ 5.79
TOPBP1Q92547 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
TOPBP1Q92547 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
TOPBP1Q92547 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC51.17■■■■■ 5.78
TOPBP1Q92547 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC51.14■■■■■ 5.78
TOPBP1Q92547 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.13■■■■■ 5.78
TOPBP1Q92547 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC51.13■■■■■ 5.78
TOPBP1Q92547 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
TOPBP1Q92547 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC51.08■■■■■ 5.77
TOPBP1Q92547 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
TOPBP1Q92547 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
TOPBP1Q92547 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC51.04■■■■■ 5.76
TOPBP1Q92547 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
TOPBP1Q92547 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
TOPBP1Q92547 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
TOPBP1Q92547 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms