Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.27■■■■■ 6.92
TRIM41Q8WV44 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.75■■■■■ 6.84
TRIM41Q8WV44 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.47■■■■■ 6.79
TRIM41Q8WV44 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.93■■■■■ 6.7
TRIM41Q8WV44 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
TRIM41Q8WV44 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.5■■■■■ 6.64
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.46■■■■■ 6.63
TRIM41Q8WV44 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.37■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.36■■■■■ 6.61
TRIM41Q8WV44 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC56.16■■■■■ 6.58
TRIM41Q8WV44 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.6■■■■■ 6.49
TRIM41Q8WV44 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.13■■■■■ 6.42
TRIM41Q8WV44 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.1■■■■■ 6.41
TRIM41Q8WV44 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.09■■■■■ 6.41
TRIM41Q8WV44 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.87■■■■■ 6.37
TRIM41Q8WV44 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.71■■■■■ 6.35
TRIM41Q8WV44 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
TRIM41Q8WV44 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
TRIM41Q8WV44 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.38■■■■■ 6.3
TRIM41Q8WV44 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.25■■■■■ 6.28
TRIM41Q8WV44 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
TRIM41Q8WV44 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
TRIM41Q8WV44 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.99■■■■■ 6.23
TRIM41Q8WV44 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
TRIM41Q8WV44 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.88■■■■■ 6.22
TRIM41Q8WV44 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
TRIM41Q8WV44 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.79■■■■■ 6.2
TRIM41Q8WV44 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.79■■■■■ 6.2
TRIM41Q8WV44 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.51■■■■■ 6.16
TRIM41Q8WV44 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.49■■■■■ 6.15
TRIM41Q8WV44 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.42■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
TRIM41Q8WV44 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
TRIM41Q8WV44 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.05■■■■■ 6.08
TRIM41Q8WV44 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.02■■■■■ 6.08
TRIM41Q8WV44 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
TRIM41Q8WV44 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
TRIM41Q8WV44 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
TRIM41Q8WV44 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
TRIM41Q8WV44 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.47■■■■■ 5.99
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC52.44■■■■■ 5.99
TRIM41Q8WV44 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
TRIM41Q8WV44 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
TRIM41Q8WV44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC52.31■■■■■ 5.96
TRIM41Q8WV44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
TRIM41Q8WV44 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.02■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.01■■■■■ 5.92
TRIM41Q8WV44 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
TRIM41Q8WV44 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.87■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
TRIM41Q8WV44 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.81■■■■■ 5.88
TRIM41Q8WV44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC51.75■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.71■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
TRIM41Q8WV44 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
TRIM41Q8WV44 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
TRIM41Q8WV44 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.41■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
TRIM41Q8WV44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.34■■■■■ 5.81
TRIM41Q8WV44 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
TRIM41Q8WV44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
TRIM41Q8WV44 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC51.18■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC51.16■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
TRIM41Q8WV44 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
TRIM41Q8WV44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC51■■■■■ 5.75
TRIM41Q8WV44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
TRIM41Q8WV44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.88■■■■■ 5.74
TRIM41Q8WV44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
TRIM41Q8WV44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
TRIM41Q8WV44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.73
TRIM41Q8WV44 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
TRIM41Q8WV44 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
TRIM41Q8WV44 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
TRIM41Q8WV44 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
TRIM41Q8WV44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
TRIM41Q8WV44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
TRIM41Q8WV44 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
TRIM41Q8WV44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
TRIM41Q8WV44 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
TRIM41Q8WV44 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TRIM41Q8WV44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
TRIM41Q8WV44 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
TRIM41Q8WV44 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
TRIM41Q8WV44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms