Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SVIPQ8NHG7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVIPQ8NHG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SVIPQ8NHG7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVIPQ8NHG7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVIPQ8NHG7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVIPQ8NHG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SVIPQ8NHG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVIPQ8NHG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SVIPQ8NHG7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SVIPQ8NHG7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVIPQ8NHG7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVIPQ8NHG7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVIPQ8NHG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVIPQ8NHG7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVIPQ8NHG7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVIPQ8NHG7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVIPQ8NHG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVIPQ8NHG7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVIPQ8NHG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVIPQ8NHG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVIPQ8NHG7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVIPQ8NHG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SVIPQ8NHG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVIPQ8NHG7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVIPQ8NHG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVIPQ8NHG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVIPQ8NHG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVIPQ8NHG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVIPQ8NHG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVIPQ8NHG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SVIPQ8NHG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVIPQ8NHG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVIPQ8NHG7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVIPQ8NHG7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVIPQ8NHG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVIPQ8NHG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVIPQ8NHG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SVIPQ8NHG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SVIPQ8NHG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SVIPQ8NHG7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SVIPQ8NHG7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SVIPQ8NHG7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SVIPQ8NHG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVIPQ8NHG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVIPQ8NHG7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SVIPQ8NHG7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SVIPQ8NHG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVIPQ8NHG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVIPQ8NHG7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms