Protein: Q8N139

ABCA6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA6Q8N139 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.42■■■■■ 5.98
ABCA6Q8N139 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
ABCA6Q8N139 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCA6Q8N139 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
ABCA6Q8N139 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
ABCA6Q8N139 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.29■■■■■ 5.64
ABCA6Q8N139 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50■■■■■ 5.6
ABCA6Q8N139 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCA6Q8N139 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
ABCA6Q8N139 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCA6Q8N139 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
ABCA6Q8N139 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCA6Q8N139 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
ABCA6Q8N139 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
ABCA6Q8N139 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCA6Q8N139 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
ABCA6Q8N139 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.96■■■■■ 5.43
ABCA6Q8N139 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
ABCA6Q8N139 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
ABCA6Q8N139 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.63■■■■■ 5.38
ABCA6Q8N139 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
ABCA6Q8N139 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
ABCA6Q8N139 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
ABCA6Q8N139 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
ABCA6Q8N139 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCA6Q8N139 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCA6Q8N139 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
ABCA6Q8N139 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCA6Q8N139 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCA6Q8N139 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
ABCA6Q8N139 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ABCA6Q8N139 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCA6Q8N139 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCA6Q8N139 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCA6Q8N139 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCA6Q8N139 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
ABCA6Q8N139 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
ABCA6Q8N139 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ABCA6Q8N139 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
ABCA6Q8N139 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCA6Q8N139 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
ABCA6Q8N139 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
ABCA6Q8N139 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
ABCA6Q8N139 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ABCA6Q8N139 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCA6Q8N139 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCA6Q8N139 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
ABCA6Q8N139 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCA6Q8N139 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
ABCA6Q8N139 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCA6Q8N139 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCA6Q8N139 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCA6Q8N139 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCA6Q8N139 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
ABCA6Q8N139 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCA6Q8N139 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCA6Q8N139 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
ABCA6Q8N139 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ABCA6Q8N139 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCA6Q8N139 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCA6Q8N139 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCA6Q8N139 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
ABCA6Q8N139 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCA6Q8N139 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCA6Q8N139 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
ABCA6Q8N139 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCA6Q8N139 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCA6Q8N139 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ABCA6Q8N139 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCA6Q8N139 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCA6Q8N139 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCA6Q8N139 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCA6Q8N139 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.46■■■■■ 4.87
ABCA6Q8N139 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCA6Q8N139 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCA6Q8N139 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCA6Q8N139 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCA6Q8N139 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCA6Q8N139 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
ABCA6Q8N139 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCA6Q8N139 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCA6Q8N139 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCA6Q8N139 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCA6Q8N139 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCA6Q8N139 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCA6Q8N139 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCA6Q8N139 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCA6Q8N139 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCA6Q8N139 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCA6Q8N139 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCA6Q8N139 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCA6Q8N139 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCA6Q8N139 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCA6Q8N139 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCA6Q8N139 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA6Q8N139 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.79
ABCA6Q8N139 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCA6Q8N139 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA6Q8N139 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCA6Q8N139 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms