Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.05■■■■■ 5.76
Rsph6aQ8CDR2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Rsph6aQ8CDR2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Rsph6aQ8CDR2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Rsph6aQ8CDR2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Rsph6aQ8CDR2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Rsph6aQ8CDR2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Rsph6aQ8CDR2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Rsph6aQ8CDR2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Rsph6aQ8CDR2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Rsph6aQ8CDR2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Rsph6aQ8CDR2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Rsph6aQ8CDR2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Rsph6aQ8CDR2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Rsph6aQ8CDR2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rsph6aQ8CDR2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rsph6aQ8CDR2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rsph6aQ8CDR2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rsph6aQ8CDR2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rsph6aQ8CDR2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Rsph6aQ8CDR2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rsph6aQ8CDR2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Rsph6aQ8CDR2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Rsph6aQ8CDR2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Rsph6aQ8CDR2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Rsph6aQ8CDR2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Rsph6aQ8CDR2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Rsph6aQ8CDR2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rsph6aQ8CDR2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Rsph6aQ8CDR2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rsph6aQ8CDR2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rsph6aQ8CDR2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rsph6aQ8CDR2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Rsph6aQ8CDR2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rsph6aQ8CDR2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rsph6aQ8CDR2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rsph6aQ8CDR2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rsph6aQ8CDR2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rsph6aQ8CDR2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsph6aQ8CDR2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rsph6aQ8CDR2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rsph6aQ8CDR2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rsph6aQ8CDR2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rsph6aQ8CDR2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Rsph6aQ8CDR2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rsph6aQ8CDR2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Rsph6aQ8CDR2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rsph6aQ8CDR2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rsph6aQ8CDR2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rsph6aQ8CDR2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rsph6aQ8CDR2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rsph6aQ8CDR2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rsph6aQ8CDR2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rsph6aQ8CDR2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rsph6aQ8CDR2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rsph6aQ8CDR2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rsph6aQ8CDR2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Rsph6aQ8CDR2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rsph6aQ8CDR2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rsph6aQ8CDR2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsph6aQ8CDR2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rsph6aQ8CDR2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsph6aQ8CDR2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rsph6aQ8CDR2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rsph6aQ8CDR2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rsph6aQ8CDR2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rsph6aQ8CDR2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsph6aQ8CDR2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Rsph6aQ8CDR2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rsph6aQ8CDR2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rsph6aQ8CDR2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rsph6aQ8CDR2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rsph6aQ8CDR2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rsph6aQ8CDR2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rsph6aQ8CDR2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rsph6aQ8CDR2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rsph6aQ8CDR2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rsph6aQ8CDR2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Rsph6aQ8CDR2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rsph6aQ8CDR2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rsph6aQ8CDR2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rsph6aQ8CDR2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsph6aQ8CDR2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Rsph6aQ8CDR2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rsph6aQ8CDR2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rsph6aQ8CDR2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rsph6aQ8CDR2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Rsph6aQ8CDR2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rsph6aQ8CDR2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rsph6aQ8CDR2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rsph6aQ8CDR2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Rsph6aQ8CDR2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rsph6aQ8CDR2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rsph6aQ8CDR2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rsph6aQ8CDR2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rsph6aQ8CDR2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms