Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Pbrm1Q8BSQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Pbrm1Q8BSQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Pbrm1Q8BSQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Pbrm1Q8BSQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Pbrm1Q8BSQ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Pbrm1Q8BSQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Pbrm1Q8BSQ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Pbrm1Q8BSQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Pbrm1Q8BSQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Pbrm1Q8BSQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Pbrm1Q8BSQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
Pbrm1Q8BSQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Pbrm1Q8BSQ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Pbrm1Q8BSQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Pbrm1Q8BSQ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Pbrm1Q8BSQ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Pbrm1Q8BSQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Pbrm1Q8BSQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Pbrm1Q8BSQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Pbrm1Q8BSQ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Pbrm1Q8BSQ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Pbrm1Q8BSQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Pbrm1Q8BSQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Pbrm1Q8BSQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Pbrm1Q8BSQ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Pbrm1Q8BSQ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Pbrm1Q8BSQ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Pbrm1Q8BSQ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Pbrm1Q8BSQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Pbrm1Q8BSQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Pbrm1Q8BSQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
Pbrm1Q8BSQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Pbrm1Q8BSQ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Pbrm1Q8BSQ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Pbrm1Q8BSQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Pbrm1Q8BSQ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Pbrm1Q8BSQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Pbrm1Q8BSQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Pbrm1Q8BSQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Pbrm1Q8BSQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Pbrm1Q8BSQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC44.5■■■■■ 4.72
Pbrm1Q8BSQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Pbrm1Q8BSQ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Pbrm1Q8BSQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Pbrm1Q8BSQ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Pbrm1Q8BSQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Pbrm1Q8BSQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Pbrm1Q8BSQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Pbrm1Q8BSQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Pbrm1Q8BSQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
Pbrm1Q8BSQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Pbrm1Q8BSQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Pbrm1Q8BSQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Pbrm1Q8BSQ9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Pbrm1Q8BSQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
Pbrm1Q8BSQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Pbrm1Q8BSQ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Pbrm1Q8BSQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms