Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd2Q8BGB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd2Q8BGB5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd2Q8BGB5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd2Q8BGB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd2Q8BGB5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd2Q8BGB5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd2Q8BGB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd2Q8BGB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd2Q8BGB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd2Q8BGB5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd2Q8BGB5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd2Q8BGB5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd2Q8BGB5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd2Q8BGB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd2Q8BGB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd2Q8BGB5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd2Q8BGB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd2Q8BGB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd2Q8BGB5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd2Q8BGB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd2Q8BGB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd2Q8BGB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd2Q8BGB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd2Q8BGB5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd2Q8BGB5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms